PRJNA906079：Crnic Institute 21三体模型图谱 成年小鼠脑组织 PolyA RNA-seq
该数据集来自 NCBI，属于 Crnic Institute 21三体模型图谱，包含成年小鼠脑组织的 PolyA RNA-seq 数据
基本信息
资源简介
PRJNA906079：Crnic Institute 21三体模型图谱 成年小鼠脑组织 PolyA RNA-seq
该数据集名为 PRJNA906079: Crnic Institute - Trisomy 21 Model Atlas: PolyA RNA-seq from adult mouse brain tissue，来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），在分类上归属于神经系统疾病 / 其他。它属于 Crnic Institute 21三体模型图谱（Trisomy 21 Model Atlas），是 Human Trisome Project 的一部分，由科罗拉多大学安舒茨医学校区 Linda Crnic 唐氏综合征研究所运行。数据集的核心内容是成年小鼠脑组织的 PolyA RNA-seq 数据，用于分析稳态 mRNA 水平，涉及野生型 C57BL/6、Dp16 以及干扰素受体剂量归一化的 Dp16^2xIFNRs 小鼠，脑组织取材时间为 17–35 周龄。主题标签为 Transcriptome or Gene expression，整体上服务于 21三体模型相关的转录组研究。
【数据集背景】
该数据集隶属于 Crnic Institute 21三体模型图谱，是 Human Trisome Project 的组成部分，由 Linda Crnic 唐氏综合征研究所（位于科罗拉多大学安舒茨医学校区）运行。其研究背景围绕 21三体（唐氏综合征）的模型系统展开，通过成年小鼠脑组织样本，考察与 21三体相关的基因表达变化。数据集涉及的动物模型包括野生型 C57BL/6、Dp16 以及干扰素受体剂量归一化的 Dp16^2xIFNRs 小鼠，旨在从转录组层面刻画脑组织中的稳态 mRNA 水平。相关项目信息可通过 http://www.trisome.org/ 获取。
【数据内容】
数据内容为 PolyA RNA-seq 数据，来源于成年小鼠脑组织，取材年龄范围为 17–35 周。所分析的目标是稳态 mRNA 水平，即对脑组织中多聚腺苷酸化 RNA 进行测序，以反映基因表达状态。样本涵盖三种基因型：野生型 C57BL/6、Dp16 以及干扰素受体剂量归一化的 Dp16^2xIFNRs。主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明该数据集属于转录组或基因表达类数据。除上述信息外，源站未提供关于测序平台、读长、样本数量、数据量等更详细的技术参数。
【采集与来源】
数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，数据集英文名称为 PRJNA906079: Crnic Institute - Trisomy 21 Model Atlas: PolyA RNA-seq from adult mouse brain tissue。样本采集自成年小鼠脑组织，年龄为 17–35 周，涉及野生型 C57BL/6、Dp16 和 Dp16^2xIFNRs 三种小鼠。项目由 Linda Crnic 唐氏综合征研究所运行，属于 Human Trisome Project - Trisomy 21 Model Atlas。关于具体的采集流程、伦理审批、样本处理与建库方法，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组或基因表达相关研究，尤其是围绕 21三体模型（唐氏综合征模型）的脑组织基因表达分析。可用于比较野生型 C57BL/6、Dp16 以及干扰素受体剂量归一化的 Dp16^2xIFNRs 小鼠在成年期脑组织中的稳态 mRNA 水平，进而探索 21三体背景下干扰素受体剂量对脑组织转录组的影响。也可作为 Crnic Institute 21三体模型图谱的一部分，用于更广泛的唐氏综合征模型转录组数据整合分析。关于具体分析流程或推荐工具，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明，包括数据下载方式、预处理步骤、比对与定量流程、标准化方法等。使用者可依据 NCBI 来源站的一般数据获取途径进行访问，但本数据集的具体操作指引未在给定信息中说明。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、批次效应、重复数、覆盖度或技术偏差等信息。已知限制方面，数据集仅涉及成年小鼠脑组织、特定年龄范围（17–35 周）以及三种指定基因型，因此适用范围受此限定。其他质量与限制信息源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可条款。数据集所属项目信息可参考 http://www.trisome.org/，但具体的引用规范与使用许可未在给定信息中说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA906079
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对来自野生型C57BL/6、Dp16以及干扰素受体剂量归一化的Dp16^2xIFNRs小鼠在17-35周龄时成年脑组织中稳态mRNA水平的分析。该数据集是科罗拉多大学安舒茨医学院Linda Crnic唐氏综合征研究所运行的Human Trisome Project - Trisomy 21 Model Atlas的一部分。http://www.trisome.org/
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
