多发性硬化症患者血清microRNA谱揭示与EB病毒相关的宿主-病毒相互作用

该数据集为NCBI BioProject收录的PRJNA1531666项目,聚焦多发性硬化症患者血清中的MicroRNA表达谱,用于揭示与Epstein-Barr病毒相关的宿主-病毒相互作用

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1531666: MicroRNA profiling in serum reveals host-virus interactions associated with Epstein-Barr virus in persons with multiple sclerosis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

多发性硬化症患者血清microRNA谱揭示与EB病毒相关的宿主-病毒相互作用

PRJNA1531666 是 NCBI BioProject 收录的一个生物项目,题为“MicroRNA profiling in serum reveals host-virus interactions associated with Epstein-Barr virus in persons with multiple sclerosis”。该项目聚焦多发性硬化症患者血清中的 MicroRNA 表达谱,旨在揭示与 Epstein-Barr 病毒相关的宿主-病毒相互作用。从分类上看,它归属于神经系统疾病 / 其他类别,主题标签为 Transcriptome or Gene expression,表明其数据属于转录组或基因表达范畴。作为 BioProject 体系中的一项记录,它为使用者提供了一个集中入口,用以查找该项目所产生的多种类型数据。整体而言,该数据集围绕多发性硬化症、血清 MicroRNA 与 Epstein-Barr 病毒三者之间的关联展开,适合关注神经免疫、病毒与宿主相互作用以及非编码 RNA 表达调控的研究者参考使用。

【数据集背景】

多发性硬化症是一种累及中枢神经系统的疾病,其病因和发病机制涉及遗传与环境因素的复杂交互,其中病毒感染作为环境因素之一长期受到关注。Epstein-Barr 病毒是一种常见的疱疹病毒,与多种免疫相关疾病存在关联。该数据集正是在这一背景下,针对多发性硬化症患者群体,通过血清 MicroRNA 表达谱的分析,探索 Epstein-Barr 病毒相关的宿主-病毒相互作用。MicroRNA 作为一类重要的基因表达调控分子,在血清中具有相对稳定的存在形式,因而被视为反映机体状态与疾病过程的潜在窗口。该项目将研究对象限定于多发性硬化症患者,并将分析材料限定为血清,从而在特定疾病与特定样本类型之间建立起联系,为理解病毒与宿主在转录后调控层面的互动提供了切入点。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression,说明其核心内容属于转录组或基因表达数据。项目名称明确指出所开展的是血清中的 MicroRNA 表达谱分析,因此数据内容围绕 MicroRNA 的表达情况展开。这些表达信息用于揭示与 Epstein-Barr 病毒相关的宿主-病毒相互作用,意味着数据不仅涉及宿主来源的 MicroRNA,还可能涉及与病毒存在关联的表达变化。作为 BioProject 记录,该项目并不局限于单一数据类型,而是提供指向该项目所生成多种数据类型的链接入口。关于具体的样本数量、测序平台、表达矩阵或差异表达结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 被描述为与单一研究计划相关的生物数据的集合,这些数据源自单一组织或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一的位置,以便找到为该项目生成的多种数据类型之间的链接。就本项目而言,其数据产生自对多发性硬化症患者血清样本的 MicroRNA 表达谱研究,研究关注 Epstein-Barr 病毒相关的宿主-病毒相互作用。关于样本采集地点、采集时间、受试者招募标准、伦理审批信息以及具体实验流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于转录组与基因表达相关的研究场景,尤其是涉及 MicroRNA 表达谱的分析工作。由于项目聚焦多发性硬化症患者血清中与 Epstein-Barr 病毒相关的宿主-病毒相互作用,因此可服务于神经免疫学、病毒学以及非编码 RNA 调控等方向的研究。研究者可以利用该 BioProject 记录作为入口,查找该项目产生的多种数据类型,进而开展比较分析、验证性研究或整合性分析。此外,对于关注血清生物标志物探索、宿主与病毒互作机制的研究者,该数据集也提供了可参考的资源线索。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物开发或特定人群的推广,源站未提供。

【使用方法】

作为 BioProject 记录,该数据集的使用方式是通过 NCBI BioProject 体系访问,用户可在该记录中获取指向项目所生成多种数据类型的链接。BioProject 的设计目的正是为与单一研究计划相关的生物数据提供集中查找入口,因此使用者可以借助该记录定位到相应的转录组或基因表达数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、参数设置或复现步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公开的生物项目记录,其描述强调为项目相关数据提供集中链接。项目主题明确限定为多发性硬化症患者血清中的 MicroRNA 表达谱,并围绕 Epstein-Barr 病毒相关的宿主-病毒相互作用展开,因此其适用范围与这一特定疾病、样本类型和病毒因素紧密相关。关于数据质量评估指标、样本量大小、批次效应、技术偏差、数据完整性或验证程度等信息,源站未提供。使用者应注意,该记录本身是项目层面的入口,具体数据质量需结合其链接的原始数据进一步判断,而相关判断依据在源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI BioProject 记录。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1531666

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在探究多发性硬化症患者(PwMS)与非多发性硬化症个体(PwoMS)血清中的病毒编码及宿主编码miRNA,以识别与多发性硬化症表型及治疗反应相关的miRNA。PwMS按低扩展残疾状态量表(EDSS)和高EDSS分层,并在发现队列(DC)和验证队列(VC)中与PwoMS进行比较。在DC中通过测序检测miRNA,并在VC中通过微滴数字PCR(ddPCR)进行验证。对每个数据集应用了多种机器学习算法。结果显示,与PwoMS相比,高EDSS的PwMS中hsa-miR-26b-5p受到抑制,而低EDSS的PwMS中hsa-miR-181d-5p受到抑制。在DC中通过测序发现的ebv-miR-BART11-5p,在VC中低EDSS相比高EDSS的PwMS中表达增加。总之,本研究识别出先前未被认识的miRNA——hsa-miR-181d-5p、hsa-miR-26b-5p和ebv-miR-BART11-5p,它们与PwMS的疾病严重程度相关。

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