产前应激重编程胎盘信号并拮抗母体免疫激活对胎脑的影响 [单细胞RNA-seq]

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1531029),主题为产前应激重编程胎盘信号并拮抗母体免疫激活对胎脑的影响,采用单细胞 RNA-seq 技术,属于转录组或基因表达类数据

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时间序列预测Transcriptome or Gene expression
PRJNA1531029: Prenatal stress reprograms placental signaling and opposes maternal immune activation effects in the fetal brain [single-cell RNA-seq]

基本信息

模态
时间序列
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

产前应激重编程胎盘信号并拮抗母体免疫激活对胎脑的影响 [单细胞RNA-seq]

该数据集为 NCBI BioProject 收录的单细胞 RNA-seq 项目,编号 1531029,英文标题为“Prenatal stress reprograms placental signaling and opposes maternal immune activation effects in the fetal brain”。从标题可知,其研究主题聚焦于产前应激如何重编程胎盘信号,以及这一过程如何与母体免疫激活对胎脑的影响产生拮抗作用。数据集在分类上归属于神经系统疾病 / 其他,主题标签为转录组或基因表达,说明其核心数据属于基因表达层面的转录组信息。整体而言,该数据集为研究孕期环境因素、胎盘信号与胎脑发育之间的分子联系提供了单细胞水平的转录组数据资源,适合关注神经发育、母胎交互及免疫激活相关机制的研究者参考使用。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号 1531029。BioProject 是围绕某一项研究计划或联盟所产生的一组生物学数据的集合,旨在为用户提供统一入口,以便查找同一项目下产生的多种数据类型。该项目的标题表明其研究背景涉及产前应激、胎盘信号重编程以及母体免疫激活对胎脑的影响,属于神经科学与发育生物学交叉的研究方向。本站将其归类为神经系统疾病 / 其他,主题标签为转录组或基因表达,说明该项目产生的数据主要服务于基因表达层面的分析。

【数据内容】

该数据集采用单细胞 RNA-seq 技术,属于转录组或基因表达类数据。其研究内容围绕产前应激对胎盘信号的重编程作用,以及这种重编程如何与母体免疫激活对胎脑的影响相对抗。项目标题中明确提及胎盘信号与胎脑,提示数据可能覆盖胎盘与胎脑相关样本的转录组信息,但具体样本数量、细胞类型、测序平台、数据文件格式与规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,收录于 NCBI BioProject,项目 ID 为 1531029。源站描述指出,BioProject 记录来自单一组织或联盟,用于汇集某一研究计划下产生的多种数据类型。除来源站与项目编号外,关于样本采集地点、时间、伦理审批、实验设计等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与分类,该数据集适用于转录组或基因表达相关研究,尤其是涉及产前应激、胎盘信号、母体免疫激活与胎脑发育之间相互作用的分析场景。单细胞 RNA-seq 数据可用于探索不同细胞类型的表达异质性,但具体适用分析类型需结合源站提供的原始数据与元数据。其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 以项目编号 1531029 进行检索与访问。BioProject 记录提供指向该项目下多种数据类型的链接,用户可据此定位相关数据。关于数据下载方式、分析流程、软件工具或预处理步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共数据库收录的项目记录。关于数据质量评估、批次效应、测序深度、覆盖度、重复性等具体质量指标,源站未提供。使用时应结合原始数据与相关文献自行判断。其他限制条件,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用方式与许可信息,源站未提供。使用时应参考 NCBI BioProject 页面及项目相关发表物中给出的引用要求与许可条款。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1531029

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

采用单细胞RNA测序技术检测与反复母体束缚应激相关的胎盘转录谱。在妊娠第17.5天,收集了三只对照组和三只应激组母鼠/窝的完整胎盘制备物。该数据集用于评估对照组和应激组样本中的细胞类型特异性基因表达、通路富集及相对细胞类型组成。本提交内容包含相关研究中小鼠胎盘单细胞RNA测序部分。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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