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创建/更新时间

2026-11-04

资源简介

PRJNA1514694：线虫肠道脂质代谢经NHR-68与肠脑信号调控分子及行为免疫

该数据集为 NCBI BioProject 收录的研究项目，编号 1514694，英文名称为“PRJNA1514694: Intestinal lipid metabolism controls molecular and behavioral immunity through NHR-68 and gut–brain signaling in C. elegans”。从标题可以看出，该项目聚焦秀丽隐杆线虫（C. elegans）中肠道脂质代谢如何通过 NHR-68 以及肠脑信号通路，对分子层面与行为层面的免疫进行调控。项目在 NCBI BioProject 中的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其产生的数据主要与转录组或基因表达相关。本站将其归入“神经系统疾病 / 其他”分类，提示该研究可能与神经相关机制或神经—免疫互作有交叉，但具体疾病关联需以源站记录为准。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级记录，用于汇集与某一项研究计划相关的多种生物数据。按照源站描述，一个 BioProject 通常源自单一机构或联合体，并为用户提供一个统一入口，以便找到该项目所产生的不同类型的数据。本项目即属于此类记录，其研究主题围绕秀丽隐杆线虫的肠道脂质代谢、NHR-68 核受体以及肠脑信号在免疫调控中的作用展开。该主题涉及代谢、神经信号与免疫之间的跨组织通讯，属于分子与行为免疫交叉的研究方向。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其数据内容与转录组或基因表达测定相关。项目标题明确指向肠道脂质代谢通过 NHR-68 和肠脑信号控制分子及行为免疫，因此可以理解为其数据应围绕这一生物学问题产生，可能涉及基因表达层面的测量结果。但除主题标签外，源站未提供更细的数据类型、样本数量、测序平台、文件格式或具体分析结果等信息。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，项目 ID 为 1514694。源站描述仅说明 BioProject 是相关生物数据的集合，来自单一机构或联合体，并提供指向多种数据类型的链接。关于本项目的具体提交机构、研究团队、样本采集地点、实验条件或时间范围，源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与标题，该数据集适用于关注秀丽隐杆线虫基因表达、转录组分析，以及肠道脂质代谢、NHR-68 与肠脑信号在免疫调控中作用的研究场景。也可用于探索分子免疫与行为免疫之间联系的生物信息学分析。由于本站分类为“神经系统疾病 / 其他”，可能对神经—免疫—代谢交叉研究具有参考价值。但具体适用性需结合源站提供的完整数据与实验设计判断，源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1514694）访问该项目，并借助 BioProject 提供的链接查找该项目生成的不同类型数据。由于源站未提供具体的数据下载方式、文件清单、分析流程或软件工具建议，无法进一步说明使用步骤。实际使用时，应以源站页面所链接的数据资源为准。

【质量与限制】

该记录为 BioProject 项目级条目，其质量与完整性取决于提交方提供的信息。源站描述仅给出 BioProject 的一般性定义，未提供本项目的质控指标、数据完整性评估、批次信息或技术验证细节。此外，本站分类“神经系统疾病 / 其他”与源站主题标签“Transcriptome or Gene expression”之间可能存在分类粒度差异，用户需注意区分。关于样本量、重复数、测序深度、覆盖度等质量相关参数，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可条款、使用限制或数据共享政策，源站未提供。用户在使用前应查阅 NCBI BioProject 页面及相关数据记录中可能附带的引用要求与许可说明。由于源站未提供具体信息，无法在此给出确切的引用格式或授权范围。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE344153

访问原始数据

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1514694

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

动物必须将有限的能量资源分配到相互竞争的防御程序中，以应对感染。在此，我们展示了保守的核激素受体NHR-68将脂肪酸代谢与秀丽隐杆线虫中分子免疫和行为免疫的神经控制整合在一起。NHR-68与NHR-10平行作用，控制参与多不饱和脂肪酸（PUFA）代谢的基因。NHR-68的缺失破坏了亚油酸（LA）稳态，损害了病原体回避行为。补充LA可恢复回避行为，而抑制fat-3（可升高LA）则增强病原体回避，相反，通过抑制fat-2而丧失LA合成则削弱了这种行为，表明LA促进行为免疫。我们进一步表明，NHR-68在肠道中起作用以调节亚油酸稳态，并且肠道脂质代谢的变化通过肠-神经元通讯影响依赖AWC的病原体回避回路。NHR-68抑制介导分子免疫反应的PMK-1/p38 MAPK和DAF-16/FOXO通路的激活。

这些发现揭示了一条肠-脑转录回路，将肠道脂质代谢与神经和免疫输出联系起来，从而阐明了一种机制，即代谢状态协调行为与分子防御以优化宿主保护。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别