PRJNA1052726：先天性中枢性低通气综合征新治疗候选物鉴定

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1052726

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

先天性中枢性低通气综合征（CCHS）是一种由PHOX2B杂合突变引起的罕见遗传病，以危及生命的呼吸缺陷为特征。PHOX2B是一种转录因子，为包含呼吸中枢的自主神经系统的特化所必需。迄今为止，患者唯一可用的治疗方法是机械通气支持。因此，识别具有潜在缓解作用的分子至关重要。来自瞬时表达野生型和变异型PHOX2B细胞的转录组数据集使得能够运行CMap在线工具，并利用体外模型鉴定出能够将PHOX2B突变蛋白重新定位到细胞核并恢复PHOX2B靶基因表达适当调控的药物化合物。随后，我们在离体后脑制备物上测试了最高效的分子，该制备物分离了中枢呼吸指令的主要组成部分。我们的结果提供证据表明，HDAC抑制剂Vorinostat（也称为SAHA）是治疗CCHS的一种有前景的分子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。