经典半乳糖血症斑马鱼模型的产前病理起源

该数据集来自 DataverseNL,围绕经典半乳糖血症(CG)的 galt 敲除斑马鱼模型,覆盖胚胎、幼体和幼鱼阶段。数据包含 galt 敲除与野生型斑马鱼的 RNA 测序结果,并对差异表达基因进行 KEGG 和 GO 富集分析,同时用 MetaPhOR 评估代谢通路变化

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dataverse
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基因组分类Medicine, Health and Life SciencesGene Expression ProfilingGalactosemiasZebrafishInborn Error of MetabolismClassic GalactosemiaTranscriptomics
Prenatal origins of pathology in a Classic Galactosemia zebrafish model

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

经典半乳糖血症斑马鱼模型的产前病理起源

Prenatal origins of pathology in a Classic Galactosemia zebrafish model

该数据集来自 DataverseNL,围绕经典半乳糖血症(CG)的 galt 敲除斑马鱼模型,覆盖胚胎、幼体和幼鱼阶段。数据包含 galt 敲除与野生型斑马鱼的 RNA 测序结果,并对差异表达基因进行 KEGG 和 GO 富集分析,同时用 MetaPhOR 评估代谢通路变化。该数据可用于研究 CG 相关转录特征在发育过程中的演变,探索产前因素对脑和卵巢长期并发症的贡献,以及支持先天性代谢缺陷的转录组学分析(来源 DOI 解析)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管早期限制饮食中的半乳糖,大多数经典半乳糖血症(CG)患者仍会出现影响大脑和卵巢的长期并发症。已有研究提出产前因素对疾病病理的贡献。我们在 galt 敲除(KO)斑马鱼模型中研究了 CG 相关转录特征的发育轨迹。对 galt KO 和野生型胚胎、幼体和幼鱼进行了 RNA 测序。使用 KEGG 和 GO 富集分析差异表达基因,并用 MetaPhOR 评估代谢通路变化。

【主题与分类】

主题标签:Medicine, Health and Life Sciences、Gene Expression Profiling、Galactosemias、Zebrafish、Inborn Error of Metabolism、Classic Galactosemia、Zebrafish、Transcriptomics。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://dataverse.nl/citation?persistentId=doi:10.34894/XNVSGK

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管早期限制饮食中的半乳糖摄入,大多数经典型半乳糖血症(CG)患者仍会出现影响大脑和卵巢的长期并发症。已有研究提出产前因素对疾病病理的贡献。我们在galt基因敲除(KO)斑马鱼模型中研究了CG相关转录特征的发展轨迹。对galt KO和野生型胚胎、幼体及幼年斑马鱼进行了RNA测序。采用KEGG和GO富集分析差异表达基因,并使用MetaPhOR评估代谢通路变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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