用于统计分析的扩散张量成像群体脑模型

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：Populational brain models of diffusion tensor imaging for statistical analysis: a complementary information in common space
• DOI：10.6084/m9.figshare.6944000.v1
• 发布日期：2018-08-08
• 文件数：3 个
• 文件总体积：928.00 KB
• 源站页面：https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Populational_brain_models_of_diffusion_tensor_imaging_for_statistical_analysis_a_complementary_information_in_common_space/6944000

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curl -L -o "2446-4740-reng-2446-474002317-gf01.jpg" "https://ndownloader.figshare.com/files/12735806"
curl -L -o "2446-4740-reng-2446-474002317-gf02.jpg" "https://ndownloader.figshare.com/files/12735818"
curl -L -o "Table_1.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/12735827"

文件清单

• 2446-4740-reng-2446-474002317-gf01.jpg（439.93 KB）
• 2446-4740-reng-2446-474002317-gf02.jpg（482.44 KB）
• Table_1.xls（5.63 KB）

文件总体积 928.00 KB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

摘要 引言：过去几十年来，人类大脑模板的探索不断进展，为了理解疾病模式，对标准弥散张量成像（DTI）数据集的需求日益凸显。为此，一些DTI模板被开发出来，以辅助组分析研究。本研究旨在为最常用的DTI模板提供补充信息，以便对弥散加权数据进行患者特异性统计分析。方法：使用131名正常受试者重建群体平均模板。经过图像预处理、重建和对角化后，利用特征值和特征向量重建定量DTI图谱，即部分各向异性（FA）、平均弥散率（MD）、相对各向异性（RA）和径向弥散率（RD）。采用逐体素程序计算平均绝对误差（MAE），该误差反映了每个定量图谱平均强度值的全局误差。

结果 MAE 值呈现较低的 MAE 估计值（max(MAE) = 0.112），表明我们的 DTI-USP-131 模板与经典 DTI-JHU-81 方法之间的误差度量合理，后者也与经典 DTI 模板具有统计学等效性（p<0.05）。因此，每个定量 DTI 图的补充标准差（SD）图可以添加到经典 DTI-JHU-81 模板中。结论 在本研究中，重建了变异性 DTI 图（SD 图），为患者特异性方法中的体素级统计分析提供了可能。最后，本文描述的脑模板（DTI-USP-131）已在网站（http://dx.doi.org/10.17632/br7bhs4h7m.1）上供研究使用，对研究和临床应用具有重要价值。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.6944000.v1（source: https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Populational_brain_models_of_diffusion_tensor_imaging_for_statistical_analysis_a_complementary_information_in_common_space/6944000）。