羟考酮自我给药诱导大鼠伏隔核microRNA与基因表达变化[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE337890

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

处方阿片类药物滥用仍是一个关键的公共卫生问题，也是阿片类药物使用障碍（OUD）发生的主要风险因素。因此，迫切需要更好地理解OUD的神经生物学机制，以开发治疗手段并应对持续的阿片类药物流行。在本研究中，我们假设microRNA调控羟考酮自我给药后的基因表达变化。为验证我们的假设，我们采用了大鼠长时程药物自我给药范式。简言之，成年雄性Sprague-Dawley大鼠被训练自我给予羟考酮（0.15mg/kg/次输注）或生理盐水，并在最后一次自我给药 session 后24小时（戒断状态）处死。收集脑组织，提取伏隔核（NAc），并进行小RNA和RNA测序处理。我们发现羟考酮自我给药改变了40个基因和16个成熟microRNA（miRNA）的表达。生物信息学预测显示，阿片类药物调控的基因是差异调控miRNA的预测靶标，提示miRNA参与了阿片类药物介导的NAc转录组变化。

此外，我们在一个独立的雄性和雌性大鼠队列中，以及在不同阶段的成瘾周期中，验证了部分这些发现。我们识别出在羟考酮戒断期间动态调控的miRNA，以及其他在整个成瘾周期不同阶段持续调控的miRNA。综上所述，我们的数据表明，miRNA可能参与阿片类药物调控的基因表达，并指出miRNA在治疗OUD方面的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。