视网膜无长突细胞极端多样性的深层进化根源[axolotl]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335334

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

无长突细胞（ACs）构成脊椎动物视网膜中一类异质性抑制性神经元，其形态和功能复杂性可与皮层中间神经元相媲美。本文整合了来自24个脊椎动物物种的单细胞和单核转录组图谱，以重建这种极端多样性的进化起源。我们鉴定出42种直系同源AC类型（oACs），其中大多数在羊膜动物中呈现一一对应关系，许多情况下在脊椎动物中也是如此。尽管核心分子身份具有保守性，但AC类型在不同物种间的丰度和基因表达存在差异，可能反映了对不同视觉生态的适应。AC多样性与视网膜神经节细胞（RGCs）的多样性呈比例关系，提示二者协同进化。最后，我们提出ACs起源于一种AC-RGC杂合前体，甘氨酸能ACs在脊椎动物进化早期发生分化，随后RGCs与GABA能ACs之间发生分叉。总之，这些发现为理解脊椎动物中一类抑制性神经元的多样性、发育和功能建立了一个统一的进化框架。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。