progenitor cell介导的中枢神经系统再生中跨胚层来源细胞谱系的自发分化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE311740

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数据说明

在稳态条件下，中枢神经系统（CNS）的轴突由少突胶质细胞髓鞘化。然而，在脱髓鞘反应中，周围神经系统（PNS）的髓鞘化胶质细胞——施万细胞（SCs）——可参与CNS的髓鞘再生。谱系追踪研究表明，许多参与CNS髓鞘再生的SCs以及髓鞘再生的少突胶质细胞，均来源于成体CNS干细胞——少突胶质祖细胞（OPCs）。本文阐述了神经上皮来源的OPCs向通常起源于神经嵴的SCs发生命运转换的机制。利用单细胞RNA测序，我们在脱髓鞘病灶中鉴定出一个共表达SC标志物的OPC亚群。在该SC预置组中，差异基因分析显示参与整合素信号传导和骨形态发生蛋白（BMP）激活的基因显著上调。

我们发现，BMP4和玻连蛋白（一种细胞外基质分子和整合素配体）是足以诱导OPC向SC分化的外部线索，它们直接作用于转录因子OLIG2和SOX10，这两个因子是少突胶质细胞和SC细胞命运的关键调控因子。我们还表明，通过抑制Olig2的表达水平并维持Sox10的表达水平，可以直接将OPC编程为SC命运。OPC来源的SC在形态和转录上与原发性SC相似，并且能够以周围型髓鞘包裹中枢神经系统轴突。我们的发现表明，环境中与损伤相关的变化会破坏少突胶质转录因子网络的稳定性，从而在中枢神经系统髓鞘再生过程中使OPC能够选择替代性的命运。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。