身痛逐瘀汤通过潜在靶向转录因子调控神经病理性疼痛大鼠背根神经节炎症基因表达

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE236592

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

身痛逐瘀汤（STZYD）是一种中药方剂，广泛应用于包括神经病理性疼痛（NPP）在内的多种疼痛性疾病。然而，STZYD的潜在药理机制仍不清楚。本研究采用大鼠脊神经结扎（SNL）模型，随后利用RNA测序（RNA-seq）筛选接受STZYD治疗的NPP模型大鼠与未接受STZYD治疗者之间的差异表达基因（DEGs），共发现301个DEGs和14个转录因子（TFs）。这些TFs的差异表达参与NPP的炎症反应、细胞凋亡、神经侵袭及神经毒性过程。随后，对本项目所获得的DEGs与这14个TFs之间的相关性进行分析，发现14个TFs与170个DEGs存在共表达，共形成715对关系对。部分DEGs富集于多个炎症免疫反应生物学过程。因此，我们推测免疫炎症相关TFs的差异表达可能通过转录调控其靶基因的差异表达，参与STZYD对NPP的治疗作用。

本研究的结果为进一步探索NPP的治疗靶点提供了参考。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。