血压改变PVAT功能与转录组:中胸主动脉缩窄大鼠模型
该数据集来自NCBI GEO,包含中胸主动脉缩窄大鼠模型的转录组表达谱数据,用于研究血压差异对胸主动脉周围脂肪组织(PVAT)功能与转录组的影响

基本信息
资源简介
血压改变PVAT功能与转录组:中胸主动脉缩窄大鼠模型
Blood pressure changes PVAT function and transcriptome: use of the mid-thoracic aorta coarcted rat
该数据集来自NCBI GEO,包含中胸主动脉缩窄大鼠模型的转录组表达谱数据,用于研究血压差异对胸主动脉周围脂肪组织(PVAT)功能与转录组的影响。数据覆盖高压侧与低压侧PVAT的基因表达差异,可用于分析压力暴露下PVAT的舒张辅助功能、抗收缩能力及脂肪生成潜力的变化,并识别差异表达基因及突触神经递质基因网络等通路(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 04 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):创建了中胸主动脉缩窄大鼠模型,以在缩窄结扎线上方与下方产生稳定的压力差。本研究发现,暴露于较高压力的胸主动脉周围PVAT辅助应力松弛的能力较结扎线下方显著降低,且似乎保留了抗收缩能力。同时,暴露于较高压力的胸主动脉周围PVAT的脂肪生成潜力较结扎线下方降低。转录组学分析表明,缩窄下方的PVAT显示出数量最多的DEGs,并伴有突触神经递质基因网络谱的升高。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL22396、10116。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE210564
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 09 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
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- OpenDataLab:
数据说明
建立了一种中段胸主动脉缩窄大鼠模型,以在缩窄结扎线上方与下方之间产生稳定的压力差。本研究发现,暴露于较高压力的胸主动脉周围PVAT在辅助应力松弛方面的能力较结扎线下方显著降低,但似乎保留了抗收缩能力。同时,暴露于较高压力的胸主动脉周围PVAT的成脂潜能较结扎线下方降低。转录组学分析表明,缩窄下方的PVAT显示出数量最多的DEGs,并伴有突触神经递质基因网络表达谱的上调。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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