Urolithin A干预的P301L额颞叶痴呆模型小鼠粪便菌群16S rRNA基因测序数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.57760/sciencedb.015bi

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数据说明

摘要：[背景] P301L Tau转基因小鼠是表征额颞叶痴呆相关Tau病理的经典动物模型。目前，公开可访问的数据库缺乏描述该小鼠品系中尿石素A治疗的标准化肠道微生物组测序数据集。[目的] 本研究采集小鼠粪便样本并组装了16S rRNA微生物测序数据集，为针对Tau相关神经退行性疾病的防治研究奠定基础数据资源。[方法] 本研究设置野生型对照（WT）、模型（P301L）和治疗（P301L-UA）小鼠组。统一饲养和干预后采集粪便样本。针对16S rRNA基因V3-V4区域的高通量测序原始双端序列经质量控制获得干净数据。序列以97%相似度阈值聚类为OTU，随后进行分类学注释和肠道微生物群分析。[结果] 该数据集包含每个样本的原始测序reads、质控后的干净reads及分类注释文件。

群落分析显示，三组共有10个优势细菌门，包括拟杆菌门、芽孢杆菌门和Patescibacteria。在属水平上，与WT组相比，P301L模型组中Dubosiella、Mucispirillum和Oscillibacter的丰度降低，而UA干预后恢复。相比之下，P301L模型组中双歧杆菌属、Rikenella、梭菌属和Faecalibaculum的丰度升高，UA处理后下降。该数据集使其他研究人员能够进一步深入探索肠道微生物群落结构。[结论]通过标准化的实验流程，该数据集系统汇编了尿石素A处理后P301L小鼠的肠道微生物组成数据。它为微生物群-肠-脑轴研究提供了稳定可靠的数据支持，t

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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