数据:随机神经元模型预测秀丽隐杆线虫多空间尺度随机搜索行为

该数据集来自 Dryad,对应一项关于秀丽隐杆线虫随机搜索行为的研究。研究基于线虫连接组构建随机搜索的数学模型,并拟合亚微米分辨率的大规模运动学分析数据

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其他预测Caenorhabditis eleganshidden Markov modelstochastic neural networkspatial orientation
Data from:  A stochastic neuronal model predicts random search behaviors at multiple spatial scales in C. elegans

基本信息

模态
其他
大小
0.222381279 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-11-03

资源简介

数据:随机神经元模型预测秀丽隐杆线虫多空间尺度随机搜索行为

Data from: A stochastic neuronal model predicts random search behaviors at multiple spatial scales in C. elegans

该数据集来自 Dryad,对应一项关于秀丽隐杆线虫随机搜索行为的研究。研究基于线虫连接组构建随机搜索的数学模型,并拟合亚微米分辨率的大规模运动学分析数据。模型可预测神经元消融与遗传扰动带来的行为效应,以及野生型行为中未预料到的特征,表明随机搜索可由两个随机神经元群体间相互抑制的神经元双稳态回路解释。数据可用于神经回路建模、行为预测及相关神经系统疾病研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2016。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):随机搜索是细菌到人类等生物用来定位随机分布且远距离不可探测食物的一种行为策略。我们研究了线虫 Caenorhabditis elegans 的这一行为,该生物具有小型且描述充分的神经系统。在此,我们从 C. elegans 连接组中抽象出随机搜索的数学模型,并拟合到亚微米分辨率下对 C. elegans 行为的大规模运动学分析。该模型预测了神经元消融和遗传扰动的行为效应,以及野生型行为中未预料到的方面。模型的预测成功表明,C. elegans 的随机搜索可以通过一个神经元双稳态回路来理解,该回路涉及两个随机神经元群体之间的相互抑制。我们的发现为理解……建立了一个统一的理论框架

【主题与分类】

主题标签:Caenorhabditis elegans、hidden Markov model、stochastic neural network、spatial orientation。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.35qv6

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.35qv6

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 222.4 MB。

数据说明

随机搜索是生物体从细菌到人类用来定位随机分布且远距离无法探测的食物的一种行为策略。我们在秀丽隐杆线虫中研究了这种行为,这是一种神经系统较小且已被充分描述的的生物。在此,我们提出了一个从秀丽隐杆线虫连接组中抽象出的随机搜索数学模型,并对其进行了拟合,该模型基于对秀丽隐杆线虫行为在亚微米分辨率下的大规模运动学分析。该模型预测了神经元消融和遗传扰动的行为效应,以及野生型行为的意外方面。模型的预测成功表明,秀丽隐杆线虫的随机搜索可以通过一个涉及两个随机神经元群体间相互抑制的神经元双稳态电路来理解。我们的发现为理解秀丽隐杆线虫的运动建立了一个统一的理论框架,并为随机搜索提供了一个可测试的神经元模型,该模型可应用于其他生物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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