长读长RNA测序鉴定C57BL/6J小鼠脑区与性别特异性mRNA异构体表达及使用数据

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长读长RNA测序鉴定C57BL/6J小鼠脑区与性别特异性mRNA异构体表达及使用数据

Data for Long-read RNA sequencing identifies region- and sex-specific C57BL/6J mouse brain mRNA isoform expression and usage

该数据集来自zenodo.org，由University of Alabama at Birmingham于2023年12月14日发布，DOI为10.5281/zenodo.10381745。数据对应230227_EJ_MouseBrainIsoDiv项目，包含比较基因列表、CPM标准化计数与格式化元数据、以及按研究设计整理的DESeq2结果等RData/Rds文件，覆盖基因水平和转录本水平的差异表达、差异转录本使用与差异转录本表达分析，可用于长读长RNA测序下小鼠脑区与性别特异性mRNA异构体表达及使用的研究复现与下游分析（来源 Zenodo，mit-license 许可）。

【数据集背景】

项目资助方：Integrating multidimensional genomic data to discover clinically-relevant predictive models。源站首次发布：2023-12-14。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：data_minus_bam.tar.gz 包含与 230227_EJ_MouseBrainIsoDiv GitHub 项目相关的 data 目录下所有文件（bam 输出除外），具体包括：- comparison_gene_lists/：该目录下的 RData 包含所有比较基因列表及 DGE、DTE 和 DTU，可用于导入 R 环境并复现分析。- all_comparison_gene_lists.Rdata - cpm_out/：该目录下的 RData 包含处理后的每百万计数和格式化元数据，供下游分析使用。- cpm_counts_metadata.RData - deseq2_data/：该目录下所有文件均为 Rds 文件，包含文件名所示研究设计的 deseq2 结果。若文件名包含“gene”，则在基因水平进行；包含“transcript”表示分析在转录本水平进行。若文件名包含两个区域，则

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 14.55 GB。数据集 DOI：10.5281/zenodo.10381745。

【主题与分类】

主题标签：long-read RNA sequencing、brain、sex、alternative splicing、gene expression、transcript usage、isoform usage。本站分类：神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面：https://zenodo.org/records/10381745

使用许可：mit-license。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-01-11，引用时请注意版本时效。