CAPS 患者昼夜节律失调数据集
源站描述介绍了昼夜节律的生理基础,即机体适应昼夜交替的能力,以及其分子机制:每个细胞内的分子钟由复杂的细胞自主转录环路构成,通过正负反馈产生周期性转录活动,其中 BMAL1 与 CLOCK 或 NPAS2 结合激活 per1、2、3 及 cryptochrome(cry1、cry2)转录,后者反过来

基本信息
资源简介
CAPS 患者昼夜节律失调数据集
该数据集来自 clinicaltrials.gov,聚焦 Cryopyrin Associated Periodic Syndrome(CAPS)及相关疾病(Familial Cold Urticaria、Muckle-Wells Syndrome、CINCA Syndrome)患者的昼夜节律失调问题。源站描述介绍了昼夜节律的生理基础,即机体适应昼夜交替的能力,以及其分子机制:每个细胞内的分子钟由复杂的细胞自主转录环路构成,通过正负反馈产生周期性转录活动,其中 BMAL1 与 CLOCK 或 NPAS2 结合激活 per1、2、3 及 cryptochrome(cry1、cry2)转录,后者反过来抑制 BMAL1/CLOCK1 转录。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):疾病:Cryopyrin Associated Periodic Syndrome、Familial Cold Urticaria、Muckle-Wells Syndrome、CINCA Syndrome。昼夜节律的特征是生理机能对昼夜交替的适应,使机体能够适应环境。这些节律由每个细胞内的分子钟产生。在分子层面,昼夜节律钟基于一个复杂的细胞自主转录环路系统。这些环路对自身施加正反馈和负反馈,产生周期性的转录活动。 在主环路中,BMAL1 转录因子与 CLOCK 或 NPAS2(Neuronal PAS Domain Protein 2)结合,激活 per1、2 和 3 以及 cryptochrome(cry1 和 cry2)的转录,后者反过来抑制 BMAL1/CLOCK1 转录活性。BMAL1/CLOCK 复合物还激活众多靶基因(per 和 cry、Rev-erb 等)的转录。
【主题与分类】
主题标签:Cryopyrin Associated Periodic Syndrome、Familial Cold Urticaria、Muckle-Wells Syndrome、CINCA Syndrome。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06544018
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源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT06544018
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- OpenDataLab:
数据说明
疾病:冷吡啉相关周期性综合征、家族性寒冷性荨麻疹、穆克尔-韦尔斯综合征、CINCA综合征。昼夜节律的特征是生理机能对昼夜交替的适应,使其能够适应环境。这些节律由每个细胞内的分子钟产生。在分子水平上,昼夜节律钟基于一个复杂的细胞自主转录环路系统。这些环路对自身施加正反馈和负反馈,产生周期性的转录活动。* 在主环路中,BMAL1转录因子与CLOCK或NPAS2(神经元PAS结构域蛋白2)结合,激活per1、2和3以及隐花色素(cry1和cry2)的转录,后者反过来抑制BMAL1/CLOCK1的转录活性。BMAL1/CLOCK复合体还激活众多靶基因(per和cry、Rev-erb等)的转录。* 其他次级环路则对第一环路的功进行精细调节。近期研究表明,固有免疫的许多方面通过抑制NLRP3炎症小体激活而受到昼夜节律的控制。
然而,昼夜节律钟对NLRP3炎症小体的调控作用尚未阐明。炎症小体是控制caspase-1活化及随之而来的白细胞介素(IL)-1β前体、pro-IL-18(一种促炎细胞因子)成熟的分子平台。自被发现以来,其功能已被广泛表征为固有免疫应答的一部分,作为病原体和危险信号(细胞外ATP(三磷酸腺苷)、大气污染物)的感受器。NLRP3(核苷酸结合结构域LRR(富含亮氨酸重复序列)和含pyrin结构域受体3)因其与显性单基因遗传综合征的遗传关联而被描述,该综合征以在无任何感染或自身免疫性疾病的情况下反复发作全身性炎症为特征,称为CAPS(冷吡啉相关周期性综合征)或冷吡啉病,是一组从轻度到最严重形式的连续疾病谱:家族性寒冷性荨麻疹综合征、Mu
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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