AI生成的海马形状变形与健康老年人认知关系分析——数据与代码

该数据集来自 datashare.ed.ac.uk,属于神经系统疾病/其他分类,包含用于分析海马形态变形的 MATLAB 代码及相关数据

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Analyses of AI-generated hippocampal shape deformations in relation to cognition in healthy older adults – Data and Code

基本信息

模态
医学影像
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

AI生成的海马形状变形与健康老年人认知关系分析——数据与代码

该数据集来自 datashare.ed.ac.uk,属于神经系统疾病/其他分类,包含用于分析海马形态变形的 MATLAB 代码及相关数据。研究基于 Lothian Birth Cohort 1936 数据,比较手工生成二值掩膜与 Laplacian 变形形状分析方法,以及基于 PointNet 架构的深度学习方法分析 SynthSeg 生成的海马二值掩膜的结果,并考察其与不同认知域的关系。可用于研究健康老年人海马形态与认知的关联,以及评估不同海马形状分析方法的原理与结果一致性(来源 datashare.ed.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):磁共振成像(MRI)衍生的海马测量已与不同认知域相关联。已开发出不同的海马形态形状分析方法,但鉴于新的基于深度学习的最先进建模方法,尚不清楚它们的原理如何关联,以及已发表的结果在正常老年人中与认知的关系方面有多一致。我们使用来自 The Lothian Birth Cohort 1936 的数据,比较了使用手工生成的二值掩膜和基于 Laplacian 的变形形状分析方法分析海马形态的结果,与使用基于 PointNet 架构的深度学习方法分析 SynthSeg 生成的海马二值掩膜的结果,及其与不同认知域的关系。此处我们提供用于分析这两种方法生成的变形的 MATLAB 代码。

【主题与分类】

主题标签:brain、magnetic resonance imaging、3D-shape modelling、cognition、ageing、Lothian Birth Cohort 1936、artificial intelligence、shape deformations、segmentation、hippocampus。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/8939

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源站:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/8939

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

磁共振成像(MRI)衍生的海马测量与不同的认知领域相关。已开发出不同的海马形态形状分析方法,但鉴于新的基于深度学习的最先进建模方法,尚不清楚它们的原理如何相关,以及已发表的结果在正常老年人中与认知的关系有多一致。我们比较了使用手动生成的二值掩模和基于拉普拉斯变形的形状分析方法分析海马形态的结果,与使用基于PointNet架构的深度学习方法分析SynthSeg生成的海马二值掩模的结果,在涉及不同认知领域时,使用了洛锡安出生队列1936的数据。在此,我们提供了用于分析两种形状变形建模方法生成的变形的MATLAB代码,并验证和比较了结果。我们还提供了每个海马网格点的变形向量文件、分析中使用的平均模板网格,以及所有统计分析结果。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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