脑膜瘤基因组改变分析:迈向脑膜瘤进展的遗传模型

该数据集包含59个不同分级的散发性脑膜瘤样本的基因组数据,通过比较基因组杂交和分子遗传学分析,检测了染色体不平衡、基因缺失与扩增等基因组改变,揭示了脑膜瘤从良性到间变性进展过程中基因组畸变的累积模式与关键遗传事件,主要用于研究脑膜瘤的遗传进展模型和肿瘤基因组学机制。

National Academy of SciencesNational Academy of Sciences
PubMed Central
1997-12-23 更新
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脑膜瘤基因组学肿瘤进展遗传模型

基本信息

创建/更新时间
1997-12-23

资源简介

该数据集是一个基因组学研究数据集,聚焦于脑膜瘤的基因组改变。数据集包含19个良性(WHO I级)、21个非典型(WHO II级)和19个间变性(WHO III级)散发性脑膜瘤样本。通过比较基因组杂交(CGH)技术检测染色体不平衡,并辅以特定染色体区域和基因的分子遗传学分析。研究发现随着恶性程度增加,基因组畸变显著累积,并识别了各分级中最常见的染色体缺失和扩增区域,如22q、1p、10号染色体等。数据还涉及CDKN2A基因纯合缺失、CDK4和MDM2扩增以及TP53基因突变分析。该数据集主要用于研究脑膜瘤进展的遗传机制,为构建脑膜瘤进展的基因组模型提供依据,适用于肿瘤基因组学、癌症进展研究和临床病理关联分析。

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https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC25103/

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数据说明

该数据集是一个基因组学研究数据集,聚焦于脑膜瘤的基因组改变。数据集包含19个良性(WHO I级)、21个非典型(WHO II级)和19个间变性(WHO III级)散发性脑膜瘤样本。通过比较基因组杂交(CGH)技术检测染色体不平衡,并辅以特定染色体区域和基因的分子遗传学分析。研究发现随着恶性程度增加,基因组畸变显著累积,并识别了各分级中最常见的染色体缺失和扩增区域,如22q、1p、10号染色体等。数据还涉及CDKN2A基因纯合缺失、CDK4和MDM2扩增以及TP53基因突变分析。该数据集主要用于研究脑膜瘤进展的遗传机制,为构建脑膜瘤进展的基因组模型提供依据,适用于肿瘤基因组学、癌症进展研究和临床病理关联分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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