低级别胶质瘤与胶质母细胞瘤中lncRNA的表达:一项计算机分析

该数据集是一个基于TCGA等公开RNA测序数据的生物信息学资源,包含超过650个脑癌样本和70个正常脑组织的lncRNA表达谱,涉及低级别胶质瘤和胶质母细胞瘤的多种亚型。数据模态主要为基因表达数据(文本/表格形式),通过识别特异性表达的lncRNA并构建生存模型,旨在探索lncRNA在脑癌发生、发展及预后中的作用,为癌症生物信息学、神经肿瘤学研究和分子标志物发现提供支持。

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2016-12-07 更新
神经胶质瘤分子标志物癌症生物信息学
创建时间2016-12-07
更新时间2016-12-07
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https://figshare.com/articles/dataset/Expression_of_lncRNAs_in_Low-Grade_Gliomas_and_Glioblastoma_Multiforme_An_In_Silico_Analysis/4291787

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资源简介

该数据集是一个专注于脑癌研究的生物信息学数据集,主要分析低级别胶质瘤(LGG)和胶质母细胞瘤(GBM)中长链非编码RNA(lncRNA)的表达谱。数据集基于来自癌症基因组图谱(TCGA)等公开资源的超过650个脑癌样本和70个正常脑组织的RNA测序数据,识别了611个诱导和677个抑制的lncRNA,并揭示了这些lncRNA在不同胶质瘤亚型(如IDH1/2突变型、1p19q共缺失型以及GBM的经典、间充质、神经和前神经亚型)中的特异性表达。通过多变量Cox回归生存模型,确定了584个与不良预后和282个与良好预后相关的lncRNA,并开发了一个基于64个lncRNA表达的生存算法,用于预测患者预后。该数据集为研究lncRNA在脑癌发生、发展和预后中的作用提供了关键资源,适用于癌症生物信息学、神经肿瘤学以及分子标志物发现等领域。

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