正常压力脑积水:研究更新

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份 Excel 表格文件,主题为正常压力脑积水的研究更新

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2024-07-15 更新
浏览 4
表格预测gut microbiotahydrocephalusinflammationmediatorMendelian randomization
Normal pressure hydrocephalus: an update

基本信息

模态
表格
大小
0.000876544 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-07-15
版本
v1

资源简介

正常压力脑积水:研究更新

Table_1_Gut microbiota linked to hydrocephalus through inflammatory factors: a Mendelian randomization study.xls

该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含一份 Excel 表格文件,主题为正常压力脑积水的研究更新。源站描述显示,研究采用孟德尔随机化方法,探讨肠道菌群与脑积水之间的因果关系,并分析炎症因子(IL-17A 和 IL-27)在其中的中介作用。数据覆盖肠道菌群、炎症因子与脑积水类型之间的关联分析,可用于神经科学及脑积水机制研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Gut Microbiota Dysbiosis Induced by Intracerebral Hemorrhage Aggravates Neuroinflammation in Mice》发表于 Frontiers in Microbiology(2021),DOI:10.3389/fmicb.2021.647304。源站首次发布:2024-07-15。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景:肠道菌群(GM)已被认为与神经系统疾病有关,但其与脑积水的关系,尤其是潜在机制通路,尚不清楚。我们采用孟德尔随机化(MR),旨在发现炎症因子在 GM 与脑积水关系中的中介作用。方法:在去除混杂因素后,使用汇总统计进行单变量和多变量 MR 分析,以评估 GM、炎症因子(IL-17A 和 IL-27)与脑积水类型之间的因果关系。采用荟萃分析来调和不同脑积水来源之间 MR 结果的差异。最后,应用中介 MR 分析以确定炎症因子的中介效应。采用多种敏感性分析方法以确保结果的可靠性和稳定性。结果:在纠正

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 876.54 KB。数据集 DOI:10.3389/fimmu.2024.1372051.s001。

【主题与分类】

源站学科分类:Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。主题标签:gut microbiota、hydrocephalus、inflammation、mediator、Mendelian randomization。本站分类:神经系统疾病/脑积水。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Transplantation Immunology、Tumour Immunology、Immunology not elsewhere classified、Immunology、Veterinary Immunology、Animal Immunology。

【获取与许可】

源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Gut_microbiota_linked_to_hydrocephalus_through_inflammatory_factors_a_Mendelian_randomization_study_xls/26301607

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Shen, Yingjie; Li, Changyu; Zhang, Xi; Wang, Yaolou; Zhang, Haopeng; Yu, Zhao; et al. (2024). Table_1_Gut microbiota linked to hydrocephalus through inflammatory factors: a Mendelian randomization study.xls. Frontiers. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_1_Gut microbiota linked to hydrocephalus through inflammatory factors: a Mendelian randomization study.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/47684926"

文件清单

  • Table_1_Gut microbiota linked to hydrocephalus through inflammatory factors: a Mendelian randomization study.xls(876.54 KB)

文件总体积 876.54 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景:肠道微生物群(GM)已被认为与神经系统疾病有关,但其与脑积水的关系,尤其是潜在的机制通路,尚不清楚。我们采用孟德尔随机化(MR)方法,旨在揭示炎症因子在GM与脑积水关系中的中介作用。方法:在排除混杂因素后,使用汇总统计数据进行单变量和多变量MR分析,以评估GM、炎症因子(IL-17A和IL-27)与各类型脑积水之间的因果关系。采用荟萃分析来调和不同脑积水来源之间MR结果的差异。最后,应用中介MR分析以确定炎症因子的中介效应。采用多种敏感性分析方法以确保结果的可靠性和稳定性。结果:经P值校正后,厚壁菌门(Firmicutes,门水平)(OR,0.34;95%CI,0.17–0.69;P = 2.71E-03,PFDR = 2.44E-02)显著降低梗阻性脑积水的风险。其余18个不同分类单元的GM与不同类型脑积水存在潜在因果关系。

此外,厚壁菌门(Firmicutes)通过提高IL-17A水平降低了梗阻性脑积水的风险(中介效应=21.01%),而瘤胃真杆菌群(Eubacterium ruminantium group,属)则通过降低IL-27水平增加了正常压力脑积水的风险(中介效应=7.48%)。结论我们揭示了肠道菌群(GM)、炎症因子(IL-17A和IL-27)与脑积水之间的联系,为阐明肠道菌群与脑积水之间的机制奠定了基础。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.3389/fimmu.2024.1372051.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Table_1_Gut_microbiota_linked_to_hydrocephalus_through_inflammatory_factors_a_Mendelian_randomization_study_xls/26301607)。

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