GRIT-Atlas(胶质母细胞瘤治疗抗性图谱)

GRIT-Atlas是一个包含978,065个细胞和296个样本的单细胞与空间转录组学数据集,聚焦于IDH野生型胶质母细胞瘤,涵盖了从诊断到治疗复发的全过程;该数据集通过整合单细胞测序和空间转录组技术,揭示了肿瘤微环境中恶性细胞、免疫抑制细胞和癌症相关成纤维细胞组成的核心功能单元及其在缺氧和坏死区域的定植机制,主要用于研究胶质母细胞瘤的治疗抗性、免疫微环境调控和空间病理学特征。

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2025-12-31 更新
胶质母细胞瘤研究单细胞空间转录组学
创建时间2025-12-24
更新时间2025-12-31
原始链接

https://github.com/Dr-fly/GRIT-Atlas

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资源简介

GRIT-Atlas(胶质母细胞瘤治疗抗性图谱)是目前最全面的IDH野生型胶质母细胞瘤(GBM)单细胞与空间分辨率资源数据集。该数据集整合了978,065个细胞和296个样本,覆盖了从初次诊断到标准治疗(SOC)以及联合免疫治疗(ICB + 抗血管生成治疗)后复发的疾病全过程。数据来源于单细胞测序和空间转录组学技术,在48个患者切片中识别出一个由cNMF7(MES样)恶性细胞、分化受阻的E-MDSCs和分泌VI型胶原的myCAFs组成的核心功能单元,该单元定植于缺氧微血管增殖(MVP)和假栅栏状坏死(PAN)微环境。研究进一步揭示了myCAFs通过胶原/纤连蛋白-CD44信号轴构建纤维化支架,从而物理排除细胞毒性T细胞并维持恶性可塑性的机制。该数据集主要应用于胶质母细胞瘤的肿瘤微环境、治疗抗性机制、免疫逃逸及空间病理学等研究方向。

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