NGS 原发性髓母细胞瘤数据集
该数据集包含原发性髓母细胞瘤的基因测序数据，数据模态为DNA测序数据，来源于FFPE样本，通过目标区域测序技术覆盖165个癌症相关基因，平均深度达490×，主要用于癌症基因组学研究，支持髓母细胞瘤的分子分型、驱动基因鉴定及精准医疗方向的分析。
基本信息
资源简介
NGS 原发性髓母细胞瘤数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《NGS primary medulloblastoma》。源站首次发布：2021-12-29。
【数据内容】
源站原始描述：Biopsy Sample. DNA from FFPE samples was subjected to the library construction with the KAPA HyperPlus Kit (Roche) and to the enrichment of sequences belonging to 165 cancer related genes using SeqCap EZ Choice Probes (Roche). Sequencing was performed using the NextSeq 500 platform (Illumina, USA) in a pair-end mode for 150 cycles in forward and reverse orientations. The mean depth of the targeted sequencing coverage for FFPE-derived DNA sample was 490×
【数据结构与技术规格】
文件数 8 个，合计 1.59 GB。数据集 DOI：10.17632/98nt6b9dvc.1。
【获取与许可】
源站页面：https://data.mendeley.com/datasets/98nt6b9dvc
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://data.mendeley.com/datasets/98nt6b9dvc
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是一个针对原发性髓母细胞瘤的基因测序数据集，包含来自福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）样本的DNA测序数据。数据通过KAPA HyperPlus试剂盒进行文库构建，并使用SeqCap EZ Choice探针富集了165个癌症相关基因的序列。测序在Illumina NextSeq 500平台上以双端150循环模式完成，目标区域平均测序深度为490×。该数据集主要用于癌症基因组学研究，特别是髓母细胞瘤的分子特征分析、基因变异检测以及潜在治疗靶点探索。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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