LinkedOmics睾丸生殖细胞肿瘤数据集

LinkedOmics 提供 TCGA-TGCT 的多组学下载与分析数据,适合共表达、临床关联和通路分析。数据格式为表格,包含156条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的睾丸癌研究。

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表格分类Testicular Germ Cell TumorsTCGA-TGCTmulti-omicsClinicalMethylationmiRNAMutationRPPARNAseqSCNV
LinkedOmics TCGA-TGCT

基本信息

模态
表格
数据量
156
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-09-27

资源简介

LinkedOmics睾丸生殖细胞肿瘤数据集

【一句话概览】

LinkedOmics 数据下载门户提供睾丸生殖细胞肿瘤(TCGA-TGCT)数据集,属于该平台在 32 种癌症类型内及跨类型分析多组学数据的一部分。该数据集涵盖临床、甲基化、miRNA、突变、RPPA、RNAseq 和 SCNV 等数据类型,标签包括 Testicular Germ Cell Tumors、TCGA-TGCT 与 multi-omics(来源 linkedomics.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Datasets for Testicular Germ Cell Tumors (TCGA-TGCT)》。

【数据内容】

源站原始描述:LinkedOmics :: Data Download LinkedOmics Analyzing multi-omics data within and across 32 cancer types Data Download Portal <- Explore LinkedOmics Datasets Cohort Overview Datasets for Testicular Germ Cell Tumors (TCGA-TGCT)

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):LinkedOmics :: 数据下载 LinkedOmics 分析32种癌症类型内部及跨类型多组学数据 数据下载门户 <- 探索LinkedOmics数据集 队列概览 睾丸生殖细胞肿瘤数据集 (TCGA-TGCT)

【主题与分类】

主题标签:Testicular Germ Cell Tumors、TCGA-TGCT、multi-omics、Clinical、Methylation、miRNA、Mutation、RPPA、RNAseq、SCNV。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.linkedomics.org/data_download/TCGA-TGCT/

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源站:https://www.linkedomics.org/data_download/TCGA-TGCT/

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

LinkedOmics 提供 TCGA-TGCT 的多组学下载与分析数据,适合共表达、临床关联和通路分析。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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