食管/胃癌靶向测序数据集(MSK, 2020)

该数据集包含487对食管/胃癌肿瘤-正常样本的靶向测序基因组数据和临床表格数据,具体涵盖突变数量、基因组改变比例、生存状态、分期、肿瘤纯度等多模态临床-基因组信息,主要用于癌症基因组学、胃癌分子亚型分析、生物标志物挖掘以及精准医疗中的治疗靶点发现研究。

MSK Data Catalog
datacatalog.mskcc.org
癌症基因组学胃癌研究
原始链接

https://datacatalog.mskcc.org/dataset/10620

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资源简介

该数据集由纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSK)于2020年发布,包含487对食管/胃癌肿瘤-正常样本的靶向测序(MSK-IMPACT)汇总数据可视化结果和临床信息。数据内容包括:癌症类型、突变数量、基因组改变比例、总生存状态、性别、原发/转移样本类型、采样年龄、队列、临床分期类别、基因组改变比例(FACETs)、TMB评分、MSI评分、病理分期类别、样本类型细节、体细胞状态、肿瘤分级和肿瘤纯度。数据集以tar格式提供原始文本组件,临床数据以tsv文件提供,拷贝数片段数据以.seg文件提供并可整合基因组查看器(IGV)可视化。该数据集主要用于癌症基因组学、胃癌分子特征研究、生物标志物发现和精准医疗应用。

提供机构:MSK Data Catalog

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影像Esophageal/Stomach Cancer Targeted Sequencing Dataset (MSK, 2020)