早期胃癌及癌前病变全标注病理切片数据集

数据覆盖最常见的分化型腺癌以及癌前病变,可为早期胃癌及其前驱病变的研究提供资源。文件共 114 个,样例为 .svs 格式切片文件,配套论文发表于 Scientific Data(2025)

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2025-07-31 更新
浏览 5
医学影像图像分割ESDDatasetEarly Gastric Cancer Annotation Dataprecancerous gastric lesions
Data from: A Fully Annotated Pathology Slide Dataset for Early Gastric Cancer and Precancerous Lesions

基本信息

模态
医学影像
大小
58.650787268 GB
任务类型
图像分割
许可
CC BY
创建/更新时间
2025-07-31
版本
v1

资源简介

早期胃癌及癌前病变全标注病理切片数据集

A Fully Annotated Pathology Slide Dataset for Early Gastric Cancer and Precancerous Lesions

该数据集来自 springernature.figshare.com,包含 104 张全切片图像(whole-slide images)与 308 条组织条带,全部取材于内镜黏膜下剥离术(ESD)标本。数据覆盖最常见的分化型腺癌以及癌前病变,可为早期胃癌及其前驱病变的研究提供资源。文件共 114 个,样例为 .svs 格式切片文件,配套论文发表于 Scientific Data(2025)。该数据可用于病理图像分析相关研究,如病变区域标注与分割等任务(来源 figshare,CC BY 许可)。

【数据集背景】

配套论文《A fully annotated pathology slide dataset for early gastric cancer and precancerous lesions》发表于 Scientific Data(2025),DOI:10.1038/s41597-025-05679-1。源站首次发布:2025-07-31。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们呈现一个综合数据集,包含 104 张全切片图像与 308 条组织条带,全部来源于内镜黏膜下剥离术(ESD)标本。该集合不仅包括最常见的分化型腺癌,还包括癌前病变,为早期胃癌及其前驱病变的研究提供了宝贵资源。

【数据结构与技术规格】

文件数 114 个,合计 58.65 GB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.28919840.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Cancer、Cancer Diagnosis。主题标签:ESD、Dataset、Early Gastric Cancer Annotation Data、precancerous gastric lesions。本站分类:肿瘤/胃癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cancer、Cancer Diagnosis。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/A_Fully_Annotated_Pathology_Slide_Dataset_for_Early_Gastric_Cancer_and_Precancerous_Lesions/28919840

使用许可:CC BY(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wang, Chunbao; Ge, Jiusong; Gao, Zeyu; Li, Chen Li (2025). A Fully Annotated Pathology Slide Dataset for Early Gastric Cancer and Precancerous Lesions. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

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文件清单

  • 0a682165-55f9-4045-b550-b943291ad1b8.svs(226.47 MB)
  • 0d55cc29-bb23-4d0d-8b79-93f70be520b8.svs(1.82 GB)
  • 0dddc3e2-b189-43fb-81c1-d0cac38f3cbd.svs(613.17 MB)
  • 1a203f16-4d3c-440a-a6f1-82619763a54c.svs(1.17 GB)
  • 1a7624bc-7aef-42a7-8d20-850030de89e7.svs(473.50 MB)
  • 1b1fbfd6-3de1-42c6-8305-d4ab74f93711.svs(269.25 MB)
  • 1b373edb-f4be-4a96-9ef1-abde719f7a28.svs(581.23 MB)
  • 2c9cf676-9029-4ee7-9b40-d30003ca4e56.svs(549.02 MB)
  • 4c28cc48-2aeb-487a-b2e7-0886d7792949.svs(751.11 MB)
  • 4cfa9a35-a912-446f-8981-0dfe169cbe30.svs(690.62 MB)
  • 4d9b4a03-38dd-437f-9e5a-cd39b11f4f68.svs(302.75 MB)
  • 4f8b14cc-ae4d-4462-aad8-2a40bdbee01a.svs(200.04 MB)
  • 4fdce538-d503-4daa-a197-b01ba40e991f.svs(1.06 GB)
  • 5aa7c0dc-494b-41b4-8257-94557dc774b9.svs(488.68 MB)
  • 5ac0530a-b5b3-4022-b79f-ecef5728fcfa.svs(632.57 MB)
  • 5daa08f1-24d4-4aa7-bf41-066870a05325.svs(523.30 MB)
  • 5f016de5-c205-4159-88de-9bf2ae7a5bfe.svs(420.13 MB)
  • 6aabe5b0-ba9f-48e5-954f-e24258dc364d.svs(448.26 MB)
  • 6c6bcc80-c875-471e-87e9-1aef6725d80e.svs(363.52 MB)
  • 6f6c4841-e772-4043-ba7f-88245fa50500.svs(524.46 MB)

文件总体积 58.65 GB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

我们呈现了一个全面的数据集,包含104幅全切片图像,共计308条组织带,均源自内镜黏膜下剥离术(ESD)标本。此集合不仅包括了最常见的分化型腺癌,还涵盖了癌前病变,为早期胃癌及其前驱病变的研究提供了宝贵的资源。

许可

CC BY

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.28919840.v1(source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/A_Fully_Annotated_Pathology_Slide_Dataset_for_Early_Gastric_Cancer_and_Precancerous_Lesions/28919840)。

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