多基因风险评分与食管癌、胃癌和肝癌关联研究数据集

该数据集包含基于8个SNP计算的多基因风险评分及其与食管癌、胃癌和肝癌关联的统计结果,数据模态为基因型与临床表格数据的结合,主要用于癌症遗传风险预测和多基因评分方法在食管、胃、肝三种癌症病因学中的研究与应用。

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2015-12-02 更新
浏览 11
Single Nucleotide PolymorphismsassociationMTR rs 1805087gisnporMTRR rs 1801394stomach cancerliver cancer206 stomach cancer casesMTHFR rs 1801133alcohol consumption status
Association between polygenetic risk score and cancers of the esophagus, stomach, and liver

基本信息

大小
0.000005632 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2015-12-02
版本
v1

资源简介

多基因风险评分与食管癌、胃癌和肝癌关联研究数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Association between polygenetic risk score and cancers of the esophagus, stomach, and liver¶.》。配套论文《Single Nucleotide Polymorphisms of One-Carbon Metabolism and Cancers of the Esophagus, Stomach, and Liver in a Chinese Population》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0109235。源站首次发布:2014-10-22。

【数据内容】

源站原始描述:†: Semi-Bayes odds ratio (SBOR) adjusted for age (5-year categories and deviation from stratum mean), sex, residency (city, rural), alcohol drinking frequency, smoking pack-years, BMI, education, H. pylori infection (in stomach cancer analyses), HBsAg (in liver cancer analyses), and plasma AFB1 levels (in liver cancer analyses), based on the assumption that genotype did not affect any of these variables. *: One-sided semi-Bayes P-values; the posterior probability that the point estimate is on th…

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 5.63 KB。Table_4.xls:application/vnd.ms-excel,5.63 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0109235.t004。

【主题与分类】

源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:Single Nucleotide Polymorphisms、association、MTR rs 1805087、gi、snp、or、MTRR rs 1801394、stomach cancer、liver cancer、206 stomach cancer cases。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biological Sciences。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Association_between_polygenetic_risk_score_and_cancers_of_the_esophagus_stomach_and_liver_182_/1212958

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Chang, Shen-Chih; Chang, Po-Yin; Butler, Brendan; Y. Goldstein, Binh; Mu, Lina; Cai, Lin; et al. (2015). Association between polygenetic risk score and cancers of the esophagus, stomach, and liver¶.. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-02,引用时请注意版本时效。

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数据集获取(Figshare)

源站:https://figshare.com/articles/dataset/_Association_between_polygenetic_risk_score_and_cancers_of_the_esophagus_stomach_and_liver_182_/1212958

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数据说明

该数据集旨在研究多基因风险评分(PRS)与食管癌、胃癌和肝癌之间的关联。数据包含基于8个单核苷酸多态性(SNP)计算的多基因风险评分,以及调整后的半贝叶斯比值比(SBOR)和单侧半贝叶斯P值等统计结果。数据来源于一项队列研究,分析中调整了年龄、性别、居住地、饮酒频率、吸烟包年、BMI、教育水平、幽门螺杆菌感染(胃癌分析中)、乙肝表面抗原(肝癌分析中)和黄曲霉毒素B1水平(肝癌分析中)等混杂因素。该数据集主要用于癌症遗传风险预测、多基因评分方法验证以及食管、胃、肝三种癌症的病因学研究。

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