使用全外显子组测序鉴定皮肤鳞状细胞癌中的基因突变

对19名韩国皮肤鳞状细胞癌患者肿瘤及配对外周血进行全外显子组测序,分析不同分化程度cSCC的基因突变。

NIAID Data Ecosystem
浏览 8
基因组皮肤鳞状细胞癌全外显子组测序
Identification of Genetic Mutations in Cutaneous Squamous cell carcinoma using Whole exome sequencing

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-16

资源简介

该数据集来源于19名韩国患者,患者于2016年至2020年接受面颊部扩大切除术,采集皮肤鳞状细胞癌(cSCC)组织及配对外周血样本。根据组织病理学评估,样本分为中至低分化cSCC(MP-D,n=9)和高分化cSCC(W-D,n=10)。研究对样本进行全外显子组测序,用于分析cSCC的基因组突变。

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数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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