小肠腺癌全外显子组体细胞突变特征数据集
该数据集是一个包含106例小肠腺癌患者样本的全外显子组测序数据的基因组数据集,通过Illumina HiSeq 4000平台生成,提供了体细胞突变、驱动基因、癌症信号通路和突变特征谱等多维度信息,主要用于癌症基因组学分析、驱动基因识别、精准医疗靶点探索以及小肠腺癌的分子遗传背景研究。
创建时间2018-03-27
更新时间2018-03-27
原始链接
https://figshare.com/articles/dataset/Exome-wide_somatic_mutation_characterization_of_small_bowel_adenocarcinoma/5967298
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资源简介
该数据集针对小肠腺癌(SBA)这一治疗选择有限的侵袭性疾病,提供了全面的体细胞突变特征分析。数据集包含106例来自芬兰人群(2003-2011年诊断)的原发性肿瘤样本的全外显子组测序数据,覆盖小肠所有三个肠段。数据通过Illumina HiSeq 4000平台进行双端测序生成,并利用OncodriveFML等方法识别驱动基因、分析癌症信号通路和等位基因失衡。研究揭示了TP53、KRAS、APC等已知基因突变,以及SOX9、ACVR2A、BRCA2等新的候选驱动基因,同时提供了突变特征谱和不同肠段的肿瘤特征比较。该数据集主要用于癌症基因组学、驱动基因识别、精准医疗靶点发现和SBA分子机制研究。
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