非黑色素细胞性皮肤癌中SMAD4甲基化与表达水平及SMAD4蛋白阳性

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04759261

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：基底细胞癌。非黑色素细胞性皮肤癌是全球最常见的癌症类型。在该癌症类型的发展中，紫外线和吸烟等环境因素受到重视。表观遗传学是由于环境因素而发生并可遗传的遗传状况。DNA甲基化等表观遗传修饰在癌变、癌症进展和转移中发挥着不可或缺的作用。TGF-/SMAD4通路在癌症发病机制中发挥肿瘤抑制作用。该通路的表观遗传改变也会导致表达水平下降，从而引发不同类型的癌症。然而，尚无研究表明非黑色素细胞性皮肤癌与SMAD4甲基化之间的表观遗传关系。在我们计划的这项研究中，旨在展示癌组织中SMAD4甲基化和SMAD4 RNA表达水平的变化。此外，还计划测量非黑色素细胞性癌症中SMAD4蛋白阳性率，作为免疫组化标志物。

在此背景下，本研究将纳入60名就诊于Trakya大学皮肤科与性病门诊、经临床和皮肤镜诊断为非黑色素细胞性皮肤癌的患者。将从患者癌变皮肤和完整皮肤获取的组织材料，在Trakya大学医学生物物理与医学病理实验室经过多个步骤进行检测。我们的项目是首个针对此课题的研究，其特点在于涵盖所有非黑色素细胞性皮肤癌、使用人体组织且样本量较大。此外，借助将获得的数据，我们认为，进一步阐明SMAD4在非黑色素细胞性癌症中的作用，以及在未来研究中将SMAD4同时用作预后因素和免疫组化标志物，将推动本研究的进展。同样，我们预期通过这一途径能够开发出不同的治疗方式，并设计出不同的功能研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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