PRJNA1418635:淋巴结内局部发热模拟增强癌症疫苗疗效

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1418635),主题为淋巴结内局部发热模拟增强癌症疫苗疗效,属于肿瘤/皮肤癌方向,涉及转录组或基因表达数据

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基因组预测Transcriptome or Gene expression
PRJNA1418635: Localized fever mimicry within lymph node potentiates cancer vaccine efficacy

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1418635:淋巴结内局部发热模拟增强癌症疫苗疗效

PRJNA1418635 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究项目,其英文标题为“Localized fever mimicry within lymph node potentiates cancer vaccine efficacy”,中文可理解为“淋巴结内局部发热模拟增强癌症疫苗疗效”。该项目在分类上归属于肿瘤方向中的皮肤癌领域,主题标签为转录组或基因表达。BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级归档机制,用于汇集围绕同一项研究计划所产生的多种类型生物学数据,使用户能够从单一入口定位到该项目所关联的各类数据资源。本项目即通过这一机制,将淋巴结内局部发热模拟与癌症疫苗疗效这一研究主题相关的数据组织在一起,供研究者检索与使用。

【数据集背景】

该数据集所对应的研究主题聚焦于淋巴结内部的局部发热模拟现象,以及这一现象对癌症疫苗疗效的增强作用。从分类信息来看,其应用方向属于肿瘤领域中的皮肤癌方向。项目以 BioProject 形式组织,意味着它并非单一类型的实验数据,而是围绕上述研究目标所产生的一组生物学数据的集合。源站描述指出,BioProject 记录来源于单一机构或联合体,并为用户提供查找该项目所生成多种数据类型链接的统一入口。因此,该数据集在背景上兼具项目归档与专题研究的双重属性,既是一个可检索的数据入口,也是一项针对肿瘤免疫治疗机制的具体研究计划。

【数据内容】

该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其涉及转录组或基因表达层面的数据。结合研究主题,可以判断这些数据与淋巴结内局部发热模拟及癌症疫苗疗效评价相关。源站未提供关于样本数量、测序平台、基因列表、表达矩阵或具体分析结果等更细粒度的信息。因此,关于数据内容的具体构成,除转录组或基因表达这一主题方向外,源站未提供更多细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject 数据库,记录编号为 1418635,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 作为 NCBI 的资源体系之一,负责汇集来自单一机构或联合体的生物学数据。源站未提供该项目的具体提交机构、样本采集地点、采集时间、实验条件或伦理审批等信息。

【适用场景】

基于其分类与主题标签,该数据集适用于肿瘤学、皮肤癌研究、癌症疫苗机制探索以及转录组或基因表达分析等方向。研究者可将其用于了解淋巴结局部发热模拟与疫苗疗效之间关系的项目级数据组织情况,也可作为检索相关转录组或基因表达数据的入口。由于源站未提供具体数据文件或分析结果,其适用场景主要停留在项目发现与数据定位层面,源站未提供更具体的应用案例或验证场景。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以项目编号 1418635 或标题关键词进行检索,进入该项目的记录页面,进而查找该项目所关联的各类数据资源链接。BioProject 的设计目的即在于提供单一入口以定位同一研究计划下的多种数据类型。源站未提供关于数据下载格式、分析流程、软件工具或操作步骤的具体说明。

【质量与限制】

该项目作为 BioProject 记录,其质量依托于 NCBI 的归档体系与提交规范。但源站未提供关于数据完整性、准确性、覆盖度或质控指标的具体信息。此外,由于源站未提供样本量、实验重复数、测序深度等细节,无法对数据质量进行进一步评估。使用者在依赖该数据集时,应注意到其作为项目索引的性质,具体数据质量需结合关联的原始数据记录加以判断。源站未提供关于限制条件的更多说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可协议或使用条款信息。使用者如需引用或使用该项目数据,应参考 NCBI BioProject 数据库的通用政策以及该项目记录页面所附的相关说明。源站未提供具体的引用文献或授权细节。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1418635

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症疫苗的发展受到免疫原性低和患者免疫反应弱的阻碍。受发热和免疫热调节的启发,我们构建了基于光热金纳米颗粒的癌症疫苗,在近红外激光照射下将引流淋巴结“加热”至39-40°C。值得注意的是,淋巴结中产生的局部热疗被证明可促进树突状细胞的抗原呈递,选择性促进辅助性T细胞17(Th17)分化,并引发强效的肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞反应,同时减少免疫抑制性调节性T细胞(Treg)的扩增,从而在小鼠黑色素瘤肺转移模型和皮下模型中产生优越的治疗效果。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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