PRJNA1395571：血管平滑肌细胞丰度是Castleman病的标志

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1395571

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数据说明

Castleman病（CD）是一种人们了解甚少的炎症性疾病，其特征为淋巴结肿大并具有独特的组织学特征。其发病机制尚不明确，导致诊断延迟和治疗受限，进而增加了患者的并发症发生率和死亡率。由于淋巴结是该疾病的关键病变组织，我们采用单细胞和空间转录组学技术，试图更深入地了解CD淋巴结的分子和细胞基础。我们发现，在单中心型CD的淋巴结中，非造血基质细胞的细胞组成发生了显著改变，且不同分子通路出现失调。相比之下，与伴有非特异性炎症的肿大淋巴结相比，CD淋巴结中的造血细胞在组成或表达上仅有少量变化。单中心型CD淋巴结中血管平滑肌细胞（淋巴结基质细胞的一个亚群）丰度升高，以及基质细胞活性普遍增强，是CD淋巴结的标志性特征。

特别是，血管平滑肌细胞标志物CD146（黑色素瘤细胞黏附分子，MCAM）的免疫组化染色，可作为区分单中心型Castleman病淋巴结与相关淋巴结病的可靠指标。总之，对Castleman病淋巴结进行的单细胞和空间转录组分析有助于识别Castleman病特有的分子和细胞特征，从而指导诊断和患者分层。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。