PRJNA1259916：多胺通过调节性T细胞功能特化调控适应性抗肿瘤免疫 [scRNA-Seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1259916

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在癌症中，代谢变化和不受控制的肿瘤生长改变了营养物质的可用性，影响抗肿瘤免疫反应。调节性T（Treg）细胞是T细胞的一个亚群，具有免疫抑制特性，并被发现还具备控制组织稳态和修复的能力。然而，这些功能如何在分子水平上受到控制，以及它们是否受到肿瘤代谢的影响，目前尚不清楚。在此，我们报告肿瘤微环境中多胺的过度释放以蛋白激酶CK2（CK2）依赖的方式指导Treg细胞向免疫抑制的功能极化。在Treg细胞中剥夺多胺以及遗传或药理学抑制CK2活性，可诱导Treg细胞的组织修复特性，这些特性协调了有效的抗肿瘤2型免疫反应，并协调组织修复机制以支持肿瘤根除。这些发现表明，靶向调节Treg细胞功能具有潜力，为癌症治疗提供了新途径。

该数据集旨在研究Treg细胞中CK2b缺陷对B16.F10黑色素瘤中T细胞区室组成的影响。总体设计：将2×10^5个B16.F10细胞接种于野生型小鼠（WT；Csnk2bfl/fl）和Foxp3-Cre × CK2b-fl/fl（KO；Csnk2bTreg-/-）小鼠（8–16周龄）。接种后第21天分离B16.F10肿瘤。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。