PRJNA1249470：基于Nanostring的黑色素瘤淋巴结转移基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1249470

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究利用Nanostring nCounter平台，探究了转移性黑色素瘤淋巴结样本中的基因表达谱。样本来自未经治疗、对免疫检查点抑制剂（ICI）治疗耐药或应答的患者。我们应用了PanCancer免疫分析面板和定制的组织驻留记忆（TRM）T细胞面板，以评估免疫细胞组成及活化状态。数据集揭示了与ICI应答相关的转录特征，包括应答者中TRM相关基因和干扰素刺激通路的富集，以及耐药肿瘤中的免疫抑制特征。这些数据为了解肿瘤驻留T细胞及肿瘤免疫微环境在塑造免疫治疗应答中的作用提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。