phs001861:单细胞分析揭示葡萄膜黑色素瘤新的演化复杂性

从名称可以看出,其主题围绕葡萄膜黑色素瘤的单细胞分析以及由此揭示的演化复杂性。该数据集的登记来源是美国国家生物技术信息中心(NCBI)站点

dbgap
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基因组分类Case Set
phs001861: Single cell analysis reveals new evolutionary complexity in uveal melanoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-01

资源简介

phs001861:单细胞分析揭示葡萄膜黑色素瘤新的演化复杂性

该数据集英文名称为 phs001861: Single cell analysis reveals new evolutionary complexity in uveal melanoma,收录于 ncbi.nlm.nih.gov,在分类体系中被归入肿瘤 / 皮肤癌,被标注为 Case Set,来源站点对其的说明是 dbGaP study (Case Set)。从名称可以看出,其主题围绕葡萄膜黑色素瘤的单细胞分析以及由此揭示的演化复杂性。

【数据集背景】

该数据集的登记来源是美国国家生物技术信息中心(NCBI)站点。在领域内,dbGaP 通常被用作存储基因型与表型关联研究数据的公共档案库,研究一般以 study 为单位登记,并以 phs 开头的编号作为该研究的唯一标识,本次的 phs001861 即属于这一类编号形式。来源站点给出的说明为 dbGaP study (Case Set),表明它以研究集合的形式被收录,并被标记为病例集合。关于该研究的具体执行机构、研究负责人、立项时间、资助来源以及研究设计等背景信息,源站未提供。

【数据内容】

源站未提供该数据集所包含的样本数量、受试者数量、数据类型(例如测序读段、表达矩阵、变异列表等)、文件格式与数据规模等具体内容。该数据集被标记为 Case Set,即以病例集合的形式组织样本;在通用语境下,这类集合通常用于围绕特定疾病状态展开的分析。至于本数据集实际涵盖的分子层次、细胞类型与观测维度,源站未提供,无法进一步说明。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,来源站点对其的说明为 dbGaP study (Case Set)。关于样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批与知情同意情况、检测或测序平台、数据处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

数据集名称指向葡萄膜黑色素瘤的单细胞分析研究,可供关注该疾病主题及相关分析方法的研究者参考。至于它具体能够支撑哪些分析任务,例如肿瘤内异质性刻画、细胞亚群鉴定、演化轨迹推断等,源站未提供,需以来源站点实际发布的内容为准。除此之外的其他适用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的获取途径、访问权限层级、申请流程、下载方式以及配套工具或分析流程说明。如需使用,应前往来源站点查询其公布的使用条件。除来源站点本身的信息之外,源站未提供更多使用方法方面的说明。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性、批次效应、覆盖度、验证情况或已知局限的说明。该数据集以 Case Set 的形式标注,即以病例集合组织数据;在一般情形下,此类设计可能不包含对照集合,因而在需要组间比较的分析中或存在一定限制。以上仅为通用层面的说明,本数据集的实际设计是否如此,源站未提供。此外,关于数据版本与更新记录,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的正式引用格式、文献出处、数据使用协议、许可条款或再分发规定。使用前请以来源站 ncbi.nlm.nih.gov 公布的要求为准。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001861

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case Set).

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