phs001177:家族性黑色素瘤中的罕见生殖系CNV

数据以家系(Family)为组织单位,属于肿瘤与皮肤癌研究方向。可用于研究家族性黑色素瘤相关的生殖系 CNV 特征,支持遗传易感性分析、家系关联研究以及肿瘤遗传学相关的分类建模等任务(来源 ncbi.nlm.nih.gov)

dbgap
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其他分类Family
phs001177: Rare Germline CNVs in Familial Melanoma

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs001177:家族性黑色素瘤中的罕见生殖系CNV

phs001177: Rare Germline CNVs in Familial Melanoma 是一个聚焦于家族性黑色素瘤中罕见生殖系拷贝数变异(CNV)的研究型数据集,收录于 NCBI 的 dbGaP 数据库,属于家系(Family)研究类型。该数据集在分类上归入肿瘤 / 皮肤癌方向,主题标签为 Family,表明其数据组织以家系为单位,而非以独立个体或细胞系为基本单元。整体来看,该资源面向肿瘤遗传学与皮肤癌研究领域,可用于探索家族性黑色素瘤相关的生殖系 CNV 特征,并支持遗传易感性分析、家系关联研究以及肿瘤遗传学相关的分类建模等任务。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,源站将其描述为 dbGaP study (Family)。

【数据集背景】

该数据集围绕家族性黑色素瘤这一肿瘤类型展开,重点关注罕见生殖系拷贝数变异。黑色素瘤属于皮肤癌的一种,而家族性聚集现象提示遗传因素在部分病例中可能发挥重要作用。以家系为组织单位的研究设计,有助于在血缘相关的个体之间追踪特定变异是否与疾病表型共分离。该数据集被归入肿瘤 / 皮肤癌分类,主题标签为 Family,说明其核心价值在于从家系层面理解生殖系 CNV 与家族性黑色素瘤之间的潜在联系。源站将其标注为 dbGaP study (Family),表明其属于 dbGaP 中家系研究类别的数据资源。

【数据内容】

该数据集的主题内容为家族性黑色素瘤中的罕见生殖系 CNV。数据以家系(Family)为组织单位,意味着其结构围绕家系成员之间的关系展开,而非仅提供孤立的个体变异记录。作为 dbGaP study (Family),其内容应涉及与家族性黑色素瘤相关的生殖系拷贝数变异信息,并可用于遗传易感性分析、家系关联研究以及肿瘤遗传学相关的分类建模等任务。关于具体的样本数量、变异位点数目、家系规模、测序深度、平台型号等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,具体收录于 dbGaP 数据库,源站描述为 dbGaP study (Family)。其分类归属为肿瘤 / 皮肤癌,主题标签为 Family。关于样本采集地点、采集时间、招募方式、伦理审批信息、测序或芯片平台、数据处理流程等具体采集与来源细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于家族性黑色素瘤相关的生殖系 CNV 特征研究,可支持遗传易感性分析,帮助识别可能与疾病风险相关的罕见拷贝数变异。同时,其家系组织方式适合开展家系关联研究,考察特定 CNV 在血缘个体间的传递与共分离模式。此外,该资源还可用于肿瘤遗传学相关的分类建模等任务,例如基于家系与 CNV 特征构建分类或预测模型。总体而言,其适用方向集中在肿瘤遗传学、皮肤癌研究以及家系层面的遗传分析。

【使用方法】

该数据集为 dbGaP study (Family),通常需通过 dbGaP 的受控访问机制获取。关于具体的数据下载方式、访问权限申请流程、所需的数据使用协议、分析工具与流程建议等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来源于 NCBI 的 dbGaP 数据库,源站描述为 dbGaP study (Family),分类为肿瘤 / 皮肤癌,主题标签为 Family。关于数据质量评估指标、缺失率、批次效应、样本量限制、家系规模限制、人群代表性等具体质量与限制信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,收录于 dbGaP,源站描述为 dbGaP study (Family)。关于具体的引用格式、文献出处、数据使用许可条款、访问限制与再分发规定等,源站未提供。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001177

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

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