phs000187:黑色素瘤高密度SNP关联分析
该数据集为dbGaP收录的黑色素瘤研究,采用病例对照与病例集设计,围绕高密度SNP关联分析展开。数据覆盖肿瘤/皮肤癌方向,主题标签包括病例对照和病例集

基本信息
资源简介
phs000187:黑色素瘤高密度SNP关联分析
phs000187 是一个以高密度单核苷酸多态性(SNP)关联分析为核心的黑色素瘤研究数据集,收录于 dbGaP 数据库,来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。该研究采用病例对照与病例集相结合的设计方式,属于肿瘤领域中皮肤癌方向的研究资源。数据集围绕黑色素瘤的遗传易感性展开,通过高密度 SNP 标记对病例与对照进行比较,以期发现与疾病相关的遗传变异。其主题标签明确标注为病例对照和病例集,反映了研究在样本组织上的基本特征。整体而言,该数据集为探索黑色素瘤遗传基础的研究者提供了一套以 SNP 关联分析为主线的数据资源,适用于皮肤癌遗传流行病学相关的研究工作。
【数据集背景】
黑色素瘤是皮肤癌中危害较大的一种类型,其发生发展涉及遗传与环境等多方面因素。随着高通量基因分型技术的发展,基于高密度 SNP 的关联研究成为识别疾病易感位点的重要手段。phs000187 正是在这一研究背景下产生的 dbGaP 收录研究,聚焦于黑色素瘤的高密度 SNP 关联分析。该研究采用病例对照与病例集的设计,旨在从遗传变异层面考察与黑色素瘤相关的标记。数据集在分类上归属于肿瘤 / 皮肤癌方向,主题标签为病例对照与病例集,体现了其在研究设计与样本构成上的基本定位。
【数据内容】
该数据集的主题内容为高密度 SNP 关联分析,研究疾病为黑色素瘤。其设计类型包括病例对照与病例集两种形式,主题标签亦相应标注为 Case-Control 与 Case Set。关于数据集所包含的具体样本数量、SNP 位点数目、基因分型平台、临床变量种类以及数据文件的具体构成等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,为 dbGaP 收录的研究项目,编号为 phs000187。源站对其的描述为 dbGaP study,设计类型标注为 Case-Control、Case Set。关于样本采集地点、采集时间、纳入与排除标准、伦理审批以及数据提交机构等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其研究主题与设计特征,该数据集可应用于黑色素瘤遗传关联研究相关场景,例如病例对照框架下的 SNP 关联分析、候选位点验证以及遗传易感性探讨等方向。数据集归属肿瘤 / 皮肤癌分类,亦可作为皮肤癌遗传流行病学研究的参考资源。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性说明,源站未提供。
【使用方法】
该数据集通过 dbGaP 平台发布,研究编号为 phs000187。关于数据访问的具体申请流程、权限分级、下载方式、数据格式说明以及配套分析工具等信息,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 dbGaP 收录的病例对照与病例集研究,其设计类型已在源站描述中明确标注。关于数据质量评估指标、基因分型质控情况、缺失率、样本重复与家系关系核查结果,以及研究在人群代表性、统计效力等方面的局限,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录研究。关于数据使用的引用规范、许可条款、数据使用协议以及出版物的致谢要求等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000187
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case-Control, Case Set).
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