单细胞转录组分析提示肿瘤微环境细胞是脑与颅外黑色素瘤转移主要区分因素的数据集

主题标签:肿瘤、皮肤癌、黑色素瘤、单细胞转录组、肿瘤微环境、脑转移、颅外转移。本数据集为肿瘤领域公开数据集,由Zenodo提供,主题涵盖肿瘤。

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基因组分类肿瘤皮肤癌黑色素瘤单细胞转录组肿瘤微环境脑转移颅外转移
Dataset for the publication Single-cell transcriptome analysis suggests cells of the tumor microenvironment as a major discriminator between brain and extracranial melanoma metastases

基本信息

模态
基因组
大小
5.208043522 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

单细胞转录组分析提示肿瘤微环境细胞是脑与颅外黑色素瘤转移主要区分因素的数据集

该数据集对应一篇关于黑色素瘤转移机制的单细胞转录组研究,英文名称为“Dataset for the publication Single-cell transcriptome analysis suggests cells of the tumor microenvironment as a major discriminator between brain and extracranial melanoma metastases”。数据集由作者Grützmann, Konrad提交,机构为Zenodo,发布时间为2025年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。其主题涵盖肿瘤、皮肤癌、黑色素瘤、单细胞转录组、肿瘤微环境、脑转移与颅外转移等方向,属于肿瘤领域公开数据集,由Zenodo提供。整体来看,该数据集围绕脑转移与颅外转移黑色素瘤之间的差异展开,尤其关注肿瘤微环境细胞在区分两类转移灶中的作用,适合用于黑色素瘤转移异质性、肿瘤微环境组成及单细胞水平转录特征等相关研究。

【数据集背景】

该数据集来源于一篇以单细胞转录组分析为核心方法的出版物,研究主题聚焦于黑色素瘤的脑转移与颅外转移之间的差异。研究提出,肿瘤微环境中的细胞可能是区分脑转移与颅外转移黑色素瘤的主要判别因素。数据集作为该出版物的配套资源,用于支撑上述研究结论的公开与复用。其所属分类为肿瘤 / 皮肤癌,来源站为doi.org,机构为Zenodo,发布时间为2025年。作者为Grützmann, Konrad。该数据集的主题标签包括肿瘤、皮肤癌、黑色素瘤、单细胞转录组、肿瘤微环境、脑转移、颅外转移,体现了其在肿瘤学、皮肤癌特别是黑色素瘤转移研究中的定位。

【数据内容】

该数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤,并涉及皮肤癌、黑色素瘤、单细胞转录组、肿瘤微环境、脑转移与颅外转移等方向。数据集英文名称明确指向单细胞转录组分析,并强调肿瘤微环境细胞在脑转移与颅外转移黑色素瘤之间的判别作用。关于数据集内部具体包含哪些文件、样本数量、细胞数目、基因表达矩阵、细胞类型注释、临床信息字段、数据格式或目录结构等内容,源站未提供。因此,无法进一步说明其数据组成、变量列表或具体数据表结构。

【采集与来源】

该数据集由Zenodo提供,来源站为doi.org,作者为Grützmann, Konrad,机构为Zenodo,发布时间为2025年。其英文名称表明该数据集是为一篇关于单细胞转录组分析的出版物而发布,研究内容涉及脑与颅外黑色素瘤转移的比较。关于样本采集地点、患者来源、伦理审批信息、测序平台、建库方法、数据处理流程、质量控制参数等具体采集与来源细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题标签与名称,该数据集适用于肿瘤学、皮肤癌、黑色素瘤、单细胞转录组、肿瘤微环境、脑转移与颅外转移等相关研究方向。潜在应用包括探索脑转移与颅外转移黑色素瘤在肿瘤微环境细胞组成上的差异,分析单细胞转录组水平上的细胞类型或状态变化,以及支持与黑色素瘤转移判别相关的后续分析。关于该数据集是否适用于临床诊断、预后预测、药物靶点发现或跨癌种比较等具体场景,源站未提供明确说明。

【使用方法】

该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,允许在署名条件下使用。关于具体的使用方式,例如如何下载、如何解压、使用何种软件或编程语言读取、是否需要特定分析流程、是否提供代码或分析脚本、是否有配套的元数据说明文件等,源站未提供。因此,无法给出详细的操作步骤或技术建议。

【质量与限制】

该数据集由Zenodo发布,作者为Grützmann, Konrad,发布时间为2025年,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可。关于数据质量、完整性、准确性、批次效应、样本量、技术偏差、覆盖度、验证情况或已知限制等内容,源站未提供。由于缺乏这些信息,无法对数据集的质量水平或使用限制做出进一步判断。

【引用与许可】

该数据集的许可为Creative Commons Attribution 4.0 International。引用时需遵循该许可的署名要求。关于具体的引用格式、DOI、出版物标题、作者列表、期刊信息或推荐引用文本等内容,源站未提供。数据集英文名称已给出,可作为识别该数据集的依据。作者为Grützmann, Konrad,机构为Zenodo,发布时间为2025年,来源站为doi.org。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.16981813

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 5.21 GB。

数据说明

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