本文所用人类黑色素瘤基因数据库

该数据集为本文所用的人类黑色素瘤基因数据库,数据下载自 TCGA 和 GEO 数据库中人类皮肤黑色素瘤相关部分,共包含 18 个文件,文件样例包括 GPX4xenaDownload.tsv 以及 GSE19234、GSE22153、GSE53118、GSE54467 等系列的 soft 与 seri

google_dataset
2026-07-08 更新
浏览 7
基因组分类肿瘤皮肤癌黑色素瘤TCGAGEO基因表达数据
About the Human Melanoma Gene Database Used in This Article

基本信息

模态
基因组
大小
0.331837987 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-07-08
版本
v1

资源简介

本文所用人类黑色素瘤基因数据库

该数据集为本文所用的人类黑色素瘤基因数据库,数据下载自 TCGA 和 GEO 数据库中人类皮肤黑色素瘤相关部分,共包含 18 个文件,文件样例包括 GPX4xenaDownload.tsv 以及 GSE19234、GSE22153、GSE53118、GSE54467 等系列的 soft 与 series matrix 文件。数据集发布于 2026-07-08,版本为 v1,DOI 为 10.17632/9hv7cyxvst.1,来源站为 data.mendeley.com,本站分类归入肿瘤 / 皮肤癌。整体来看,该数据集面向人类皮肤黑色素瘤的基因数据整理与再利用,适合作为相关研究的输入数据集合。

【数据集背景】

该数据集的名称为“About the Human Melanoma Gene Database Used in This Article”,即本文所用的人类黑色素瘤基因数据库。其定位是为一篇研究文章提供配套的基因数据集合,聚焦人类皮肤黑色素瘤这一肿瘤类型。数据集从 TCGA 与 GEO 两个公共数据库的人类皮肤黑色素瘤相关部分下载整理而成,属于对既有公共数据的汇集与再组织,而非新产生的实验数据。本站将其归入肿瘤 / 皮肤癌分类,与其主题一致。

【数据内容】

数据集共包含 18 个文件,文件样例包括 GPX4xenaDownload.tsv,以及 GSE19234、GSE22153、GSE53118、GSE54467 等系列的 soft 文件与 series matrix 文件,例如 GSE19234_family.soft.gz、GSE19234_series_matrix.txt.gz、GSE22153_family.soft.gz、GSE22153_series_matrix.txt.gz、GSE53118_family.soft.gz、GSE53118_series_matrix.txt.gz、GSE54467_family.soft.gz 等。从文件构成看,数据以表格型 TSV 文件与 GZIP 压缩包两种形式存在,其中 soft 与 series matrix 文件对应不同的 GEO 系列。数据文件合计 331.84 MB。

【采集与来源】

数据来源为 TCGA 和 GEO 数据库,具体取自其中关于人类皮肤黑色素瘤的部分。数据集通过 data.mendeley.com 发布,DOI 为 10.17632/9hv7cyxvst.1,版本为 v1,发布时间为 2026-07-08。除上述来源信息外,源站未提供更细的采集流程、样本筛选标准或时间范围说明。

【适用场景】

该数据集适用于人类皮肤黑色素瘤相关的基因数据整理与分析工作,可作为研究文章中基因层面分析的输入数据集合。由于数据同时来自 TCGA 与 GEO,并包含多个 GEO 系列,适合用于跨系列的数据核对与整合性使用。具体的研究结论或分析目标,源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载全部 18 个数据文件,合计 331.84 MB。读取时按文件格式区分处理:TSV 表格文件按表格方式读取,GZIP 压缩包需先解压或按压缩格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段或编码不一致导致的批量处理错误。更详细的字段说明与读取参数,源站未提供。

【质量与限制】

数据集的文件数量、文件样例、总体积与来源信息明确,但源站未提供各文件的字段定义、样本量、缺失值情况、数据更新记录或质量控制指标。由于数据来自 TCGA 与 GEO 的下载整理,其质量与限制在很大程度上取决于原始数据库,具体细节源站未提供。使用时应注意不同 GEO 系列之间的差异,并在小样本核对阶段确认字段与编码的一致性。

【引用与许可】

引用该数据集时可使用其 DOI:10.17632/9hv7cyxvst.1,并注明版本 v1 与发布来源 data.mendeley.com。关于许可条款、使用限制与正式引用格式,源站未提供。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://data.mendeley.com/datasets/9hv7cyxvst

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 331.8 MB。

数据说明

欣雨 李 (2026). About the Human Melanoma Gene Database Used in This Article [Dataset]. http://doi.org/10.17632/9hv7cyxvst.1

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。