靶向裂解性KSHV基因产物的细胞毒性T细胞浸润卡波西肉瘤肿瘤

该数据集包含来自144名卡波西肉瘤患者的肿瘤活检样本的T细胞受体测序数据,主要数据模态为基因序列和临床表格信息,通过分析TCR库鉴定出针对KSHV裂解基因产物和HIV抗原的特异性T细胞受体,旨在研究肿瘤浸润T细胞的免疫特征、揭示病毒特异性公共T细胞反应,并为开发基于T细胞的免疫疗法治疗卡波西肉瘤等KSHV相关疾病提供实验依据和潜在靶点。

Zenodo
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2026-06-01 更新
肿瘤浸润T细胞分析疱疹病毒特异性免疫治疗
创建时间2026-06-01
更新时间2026-06-01
原始链接

https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.20410090

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资源简介

该数据集聚焦于卡波西肉瘤相关疱疹病毒(KSHV)感染引发的恶性肿瘤,特别是卡波西肉瘤(KS)。数据集包含来自144名乌干达成人KS患者(其中106人为HIV感染者,38人为HIV阴性)的肿瘤活检样本的T细胞受体(TCR)测序数据,通过生物信息学方法预测并鉴定了超过4,000个αβ TCR,这些TCR对KSHV或HIV编码的肽段具有特异性。研究验证了其中14个推定的TCR的抗原识别能力,首次发现了针对KSHV裂解基因(如ORF6、ORF57、ORF59)产物的公共T细胞反应。该数据集主要用于研究KSHV特异性T细胞在肿瘤微环境中的浸润特征、TCR库的多样性,以及为开发基于T细胞的免疫疗法(如针对KS和其他KSHV相关疾病的治疗)提供关键靶点和数据支持。

提供机构:Zenodo

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影像Cytotoxic T cells targeting lytic KSHV gene products infiltrate Kaposi sarcoma tumors