人类视网膜母细胞瘤空间转录组学图谱

该数据集提供了人类视网膜母细胞瘤的空间转录组学数据,包含基因表达谱和空间位置信息,旨在解析肿瘤异质性、微环境组成及细胞间通讯网络。数据模态主要为空间转录组测序数据,来源于人类视网膜和RB肿瘤组织。其主要用途是研究RB的肿瘤进展机制、识别关键信号通路,并为开发靶向治疗策略提供分子层面的空间生物学依据。

Human Cell Atlas Data Portal
2025-11-07 更新
创建时间2024-02-13
更新时间2025-11-07
原始链接

https://explore.data.humancellatlas.org/projects/1662accf-0e0c-48c4-9314-5aba063f2220

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资源简介

该数据集是一个针对人类视网膜母细胞瘤(Retinoblastoma,RB)的空间转录组学数据集。RB是儿童中最常见的眼内恶性肿瘤之一。数据集通过空间转录组技术对人类视网膜和RB肿瘤进行测序分析,旨在全面解析肿瘤的空间细胞-细胞通讯网络。数据揭示了RB肿瘤内部的高度异质性,包含10个转录特征不同的亚群,这些亚群具有不同的增殖能力。研究还发现肿瘤微环境主要由视锥前体细胞、胶质细胞和癌症相关成纤维细胞构成。通过描绘RB恶性进展的细胞轨迹,识别了驱动RB进展的关键信号通路,并探索了RB亚群间介导细胞通讯的信号通路,绘制了RB亚群及其邻近区域的空间网络。该数据集构建了首个RB空间基因图谱,为理解RB进展中复杂的空间通讯提供了新见解。

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影像Spatial transcriptomic profiling of human retinoblastoma