RNF185 调控 COL3A1 表达限制前列腺癌迁移与转移潜能

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD045473

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

RNF185是一种含有RING指结构域的泛素连接酶，参与内质网相关降解过程。前列腺肿瘤患者数据分析显示，RNF185表达与前列腺癌进展及转移呈负相关。同样，在RNF185缺失后，几种前列腺癌细胞系在培养中表现出更强的迁移和侵袭能力。将稳定表达针对RNF185的shRNA的小鼠前列腺癌MPC3细胞皮下接种到小鼠体内，导致肿瘤更大且肺转移更频繁。RNA测序和Ingenuity通路分析发现，与对照前列腺癌细胞相比，RNF185缺失细胞中伤口愈合和细胞运动是最显著上调的通路之一。在RNF185低表达患者样本和RNF185缺失细胞系中进行的基因集富集分析证实了与EMT相关基因的失调。其中，COL3A1被确定为RNF185影响迁移表型能力的主要介质。相应地，共同抑制COL3A1后，RNF185敲低前列腺癌细胞的增强迁移和转移能力被减弱。

我们的研究结果确定了RNF185作为前列腺癌转移的守门人，部分通过其对COL3A1可用性的控制来实现。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。