DNA高甲基化沉默Hsa-miR-1-2/miR-133a-1簇触发前列腺癌侵袭性相关癌基因

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA751617

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们建立了一种代谢综合征（MeS）样疾病模型，使用长期喂食高脂饮食（HFD）的C57BL/6J小鼠，并接种TRAMP-C1前列腺癌（PCa）细胞，以研究HFD对癌症相关miRNA表达的影响。在本数据集中，我们纳入了从对照组饮食（CD）与高脂饮食（HFD）C57BL/6J雄性小鼠中发展的TRAMP-C1肿瘤所获得的表达数据。对于差异表达分析，我们使用了两类非配对数据的Rank Product方法，并将错误发现率（FDR）设定为< 0.05。总体设计：C57BL/6J雄性小鼠喂食高脂饮食（HFD）15周，然后皮下注射TRAMP-C1小鼠前列腺癌细胞。动物在第27周被处死，处理肿瘤样本，提取总RNA，并与GeneChip® miRNA 4.0 Array（Affymetrix）进行杂交。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。