前列腺癌PM154细胞系中的组合E2F敲低
该 NCBI BioProject(ID 1526794)标题涉及前列腺癌中的组合 E2F 敲低,源站标签为转录组或基因表达

基本信息
资源简介
前列腺癌PM154细胞系中的组合E2F敲低
Combinatorial E2F knockdown in the prostate cancer... (ID 1526794) - BioProject - NCBI
该 NCBI BioProject(ID 1526794)标题涉及前列腺癌中的组合 E2F 敲低,源站标签为转录组或基因表达。其原始描述说明,BioProject 是围绕单一倡议、来自单一组织或联盟的生物数据集合,BioProject 记录为用户提供单一位置,以查找为该项目生成的不同数据类型链接(来源 NCBI)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):BioProject 是与单一研究计划相关的一组生物学数据,源自单一机构或一个联盟。BioProject 记录为用户提供了一个统一入口,以便找到指向该项目所生成的各种数据类型的链接。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/前列腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1526794
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1526794
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
治疗诱发的神经内分泌前列腺癌(CRPC-NE)在雄激素受体靶向治疗的作用下,通过RB1缺失和谱系可塑性而发生,造成组成性E2F转录因子成瘾,而目前缺乏对其实施有效治疗性利用的手段。所有六个E2F家族成员都在其二聚化结构域内携带一个保守的U12型次要内含子——仅由次要剪接体加工——从而形成一个单一的转录后节点,抑制该节点可同时靶向整个激活型E2F程序。组合式E2F敲低RNA-seq显示,E2F3是占主导地位的激活型E2F,并揭示了E2F家族作为神经内分泌身份守门者所起的矛盾性双重作用——完全耗竭E2F会释放一个ASCL1驱动的分化程序,类似于胰腺β细胞特化。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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