XPO5 经 MITF-ACSL4 信号调控铁死亡驱动 CRPC 进展并可成药靶点研究患者数据

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1492486),主题为 XPO5 通过 MITF-ACSL4 信号调控铁死亡,进而驱动去势抵抗性前列腺癌(CRPC)进展,并作为可成药靶点,属于患者样本数据

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时间序列分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA1492486: XPO5 regulates ferroptosis via MITF‑ACSL4 signaling to drive CRPC progression and serves as a druggable target [patient]

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

XPO5 经 MITF-ACSL4 信号调控铁死亡驱动 CRPC 进展并可成药靶点研究患者数据

该数据集为 NCBI BioProject 收录的编号 1492486 项目,英文名称为“PRJNA1492486: XPO5 regulates ferroptosis via MITF‑ACSL4 signaling to drive CRPC progression and serves as a druggable target [patient]”。其研究主题围绕 XPO5 通过 MITF‑ACSL4 信号通路调控铁死亡,进而驱动去势抵抗性前列腺癌(CRPC)进展,并探讨其作为可成药靶点的潜力。数据集属于患者样本数据,主题标签为转录组或基因表达。本站将其归类于肿瘤 / 前列腺癌方向。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,以 BioProject 形式组织,为用户提供查找该项目所生成各类数据的统一入口。

【数据集背景】

该数据集对应的研究聚焦于去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的进展机制。CRPC 是前列腺癌治疗中的难点阶段,患者对雄激素剥夺治疗产生抵抗后,疾病往往继续进展。该研究提出 XPO5 通过 MITF‑ACSL4 信号通路调控铁死亡,从而驱动 CRPC 进展,并进一步将其视为一个可成药的靶点。这一背景决定了该数据集在肿瘤生物学、前列腺癌机制研究以及潜在治疗靶点发现方面具有明确的研究导向。数据集以患者样本为对象,说明其关注的是临床相关样本中的转录组或基因表达特征,而非单纯细胞系或动物模型数据。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。BioProject 作为生物数据的集合,围绕单一研究计划组织,来源于单一组织或联盟,并提供链接以访问该项目产生的多种数据类型。就本数据集而言,其核心内容应围绕 XPO5、MITF、ACSL4 及铁死亡相关信号在 CRPC 患者样本中的基因表达或转录组特征展开。然而,关于具体样本数量、测序平台、数据文件格式、基因列表、表达矩阵或差异表达结果等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 1492486。BioProject 记录本身并不直接等同于某一类具体实验数据,而是作为项目入口,汇集由该研究计划产生的多种数据类型的链接。数据集名称中标注了“[patient]”,提示其涉及患者样本。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、患者人群特征、样本处理流程、测序或检测方法等具体采集信息,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与数据类型,该数据集适用于转录组或基因表达相关的分析场景,尤其是围绕前列腺癌、去势抵抗性前列腺癌、铁死亡调控机制以及 XPO5‑MITF‑ACSL4 信号轴的研究。潜在应用包括:探索 CRPC 患者样本中相关基因的表达变化;分析铁死亡相关通路在 CRPC 进展中的潜在作用;评估 XPO5 作为可成药靶点的表达证据;以及为后续功能验证或药物靶点研究提供转录组层面的参考。由于该数据集被归类于肿瘤 / 前列腺癌,也可用于肿瘤分子机制研究中的表达谱比较或通路富集分析。但具体适用性仍需结合源站提供的实际数据范围和实验设计来判断。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录(ID 1492486)访问。BioProject 为用户提供单一入口,以查找该项目生成的多种数据类型。用户通常可依据项目页面中的链接跳转至相关数据资源,如下载转录组或基因表达数据、查看样本信息或关联的其他数据库记录。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤或代码示例,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共数据库收录的项目记录,其数据组织遵循 BioProject 的一般框架。然而,关于数据质量指标、测序深度、覆盖度、重复性、批次效应、样本量、统计功效以及潜在偏倚等信息,源站未提供。此外,该数据集名称中标注为患者样本,但患者数量、临床分期、治疗背景、对照设置等关键限制因素均未在已有信息中说明。因此,在使用该数据集时,应首先查阅源站项目页面以获取完整的数据描述和质量评估信息。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发或商业使用等信息,源站未提供。用户在使用前应访问 NCBI BioProject 对应页面,查看该项目的官方引用要求与数据使用政策。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1492486

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们对四例前列腺癌患者的肿瘤组织进行了转录组分析,其中包括两例早期病例(T1cN0M0、T2cN0M0)和两例晚期病例(T3bN1M1、T4N1M1),以鉴定前列腺癌进展的新分子驱动因素。通过差异表达分析,我们将XPO5鉴定为关键致癌因子,并进一步阐明了XPO5促进前列腺癌恶性进展的机制。此外,我们开发了首个靶向XPO5的小分子降解剂,作为前列腺癌的潜在靶向治疗剂。该数据集为剖析分期特异性基因表达改变和探索前列腺癌治疗靶点提供了有价值的转录组资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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