PRJNA1470657:肾上腺来源因子驱动骨内硬化性前列腺癌进展
该数据集来自 NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦肾上腺来源因子对骨内硬化性前列腺癌进展的驱动作用。源站描述涉及胫骨内异种移植模型(VCaP、22Rv1、LNCaP 细胞),比较去势(ORX)与去势加肾上腺切除(ORX+ADX)条件下肿瘤移植胫骨的骨密度变化及肿瘤发生率,并提及转录组分析

基本信息
资源简介
PRJNA1470657:肾上腺来源因子驱动骨内硬化性前列腺癌进展
该数据集来自 NCBI,主题为转录组或基因表达,聚焦肾上腺来源因子对骨内硬化性前列腺癌进展的驱动作用。源站描述涉及胫骨内异种移植模型(VCaP、22Rv1、LNCaP 细胞),比较去势(ORX)与去势加肾上腺切除(ORX+ADX)条件下肿瘤移植胫骨的骨密度变化及肿瘤发生率,并提及转录组分析。数据可用于研究去势抵抗性前列腺癌骨转移中肾上腺贡献相关的基因表达特征(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):骨转移是前列腺癌(PC)患者死亡的主要原因。尽管雄激素剥夺治疗(ADT)联合新型雄激素靶向药物构成全身治疗的基石,但其疗效有限。我们使用临床前胫骨内异种移植模型(VCaP、22Rv1 和 LNCaP 细胞)研究了肾上腺在促进骨内去势抵抗性前列腺癌(CRPC)进展中的作用。小鼠接受睾丸切除(ORX)以模拟 ADT,伴或不伴肾上腺切除(ORX+ADX)以消除肾上腺贡献。与对照组相比,ORX 治疗小鼠的肿瘤移植胫骨中观察到骨密度(BMD)显著增加(p<0.001),表明强烈的肿瘤诱导硬化反应。相反,ORX+ADX 使肿瘤发生率降低约 50%,并使肿瘤诱导的 BMD 降低超过 80%(p<0.001)。转录组分析重
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:肿瘤/前列腺癌。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1470657
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- OpenDataLab:
数据说明
骨转移是前列腺癌(PC)患者的主要死亡原因。尽管雄激素剥夺治疗(ADT)联合新型雄激素靶向药物构成了全身治疗的基石,但其疗效有限。我们利用临床前胫骨内异种移植模型(VCaP、22Rv1和LNCaP细胞)研究了肾上腺在促进骨内去势抵抗性前列腺癌(CRPC)进展中的作用。小鼠接受睾丸切除术(ORX)以模拟ADT,并在此基础上联合或不联合肾上腺切除术(ORX+ADX)以消除肾上腺的贡献。与对照组相比,ORX处理小鼠的荷瘤胫骨中观察到骨密度(BMD)显著增加(p<0.001),表明存在强烈的肿瘤诱导的硬化性反应。相反,ORX+ADX使肿瘤成瘤率降低约50%,并使肿瘤诱导的BMD降低超过80%(p<0.001)。转录组分析显示,ADX使骨内肿瘤诱导的转录本下调超过90%,包括成骨性(Lox、Sparcl1、Bmp2、Postn、Col1a1)和促血管生成性(Bmper、Pecam-1、Esam)特征基因。此外,BMP、PI3K/Akt和ERK1/2信号通路与肿瘤诱导的骨反应相关。
高血清孕酮和肿瘤内二氢睾酮(DHT)水平均与硬化性骨表型相关。ADX显著降低了肿瘤内DHT,并下调了糖酵解基因(HK2、PFK2、LDHA)以及肿瘤表达的分泌蛋白,包括Stanniocalcin 2,后者可能在硬化性骨反应中介导旁分泌效应。总之,这些发现突显了肾上腺依赖性雄激素合成,特别是通过孕酮途径,在驱动骨内硬化性CRPC中的关键作用。我们的研究结果表明,全面阻断肾上腺的贡献对于预防与CRPC相关的硬化性骨反应至关重要。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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