原代人前列腺癌相关成纤维细胞(CAFs)对ADT与Enzalutamide响应的转录组图谱

该数据集来自 NCBI BioProject(ID 1453527),主题为原代人前列腺癌相关成纤维细胞(CAFs)在雄激素剥夺治疗(ADT)与 Enzalutamide 处理下的转录组表达谱

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时间序列回归Transcriptome or Gene expression
PRJNA1453527: Transcriptomic profiling of primary human prostate cancer-associated fibroblasts (CAFs) in response to ADT and Enzalutamide

基本信息

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创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

原代人前列腺癌相关成纤维细胞(CAFs)对ADT与Enzalutamide响应的转录组图谱

该数据集为 NCBI BioProject 收录的转录组研究项目,编号 PRJNA1453527,英文名称为“Transcriptomic profiling of primary human prostate cancer-associated fibroblasts (CAFs) in response to ADT and Enzalutamide”。其研究主题聚焦于原代人前列腺癌相关成纤维细胞(CAFs)在雄激素剥夺治疗(ADT)与 Enzalutamide 处理条件下的转录组表达谱,属于肿瘤学中前列腺癌研究方向。数据集归类于肿瘤 / 前列腺癌,主题标签为 Transcriptome or Gene expression,表明其核心数据类型为转录组或基因表达信息。该资源来自 ncbi.nlm.nih.gov,以 BioProject 形式组织,旨在为围绕同一研究计划产生的多种生物数据提供统一入口,便于用户查找和关联该项目所生成的不同类型数据。

【数据集背景】

前列腺癌是男性常见的恶性肿瘤之一,雄激素受体信号通路在其发生发展中具有重要作用。雄激素剥夺治疗(ADT)和 Enzalutamide 是前列腺癌治疗中常用的内分泌治疗手段。肿瘤微环境中的癌相关成纤维细胞(CAFs)在肿瘤进展、治疗反应及耐药机制中可能扮演重要角色。该 BioProject 围绕原代人前列腺癌相关成纤维细胞展开转录组分析,考察其在 ADT 与 Enzalutamide 处理下的基因表达变化,以期为理解前列腺癌治疗过程中基质细胞层面的分子响应提供数据基础。源站未提供该研究的具体实验背景、立项机构及研究假设等更多细节。

【数据内容】

该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression,说明其内容属于转录组或基因表达范畴。项目名称明确指向原代人前列腺癌相关成纤维细胞在 ADT 与 Enzalutamide 处理下的转录组表达谱,因此数据内容应围绕该类细胞在不同处理条件下的基因表达信息展开。BioProject 作为生物数据的集合,可提供指向该项目所生成的不同数据类型及其相关资源的链接。源站未提供样本数量、测序平台、数据文件格式、数据量大小、具体基因列表或表达矩阵等细节。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject,源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 1453527。BioProject 记录通常来自单一机构或联盟,用于汇集与某一研究计划相关的生物数据,并为用户提供统一入口以查找该项目产生的多种数据类型。该项目的英文名称表明其研究对象为原代人前列腺癌相关成纤维细胞,处理条件包括 ADT 与 Enzalutamide。源站未提供样本采集地点、患者来源、伦理审批信息、实验操作流程及数据处理方法等具体内容。

【适用场景】

该数据集适用于前列腺癌肿瘤微环境、癌相关成纤维细胞、雄激素剥夺治疗及 Enzalutamide 治疗响应等方向的转录组研究。研究人员可利用该 BioProject 查找与前列腺癌 CAFs 在 ADT 和 Enzalutamide 处理下基因表达变化相关的数据资源,用于探索治疗条件下基质细胞的分子响应特征,或作为相关转录组分析的参考数据入口。由于 BioProject 可链接多种数据类型,该资源也可用于整合同一项目下的不同数据层面。源站未提供该数据集在具体研究场景中的使用案例或分析结论。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以项目编号 PRJNA1453527 或相关英文名称进行检索,访问该项目的记录页面。BioProject 记录提供指向该项目所生成的不同数据类型及其相关资源的链接,用户可据此进一步获取转录组或基因表达数据。具体的数据下载方式、分析流程、软件工具及参数设置等内容,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 NCBI BioProject,属于公共生物数据资源。其主题标签为 Transcriptome or Gene expression,项目名称为原代人前列腺癌相关成纤维细胞在 ADT 与 Enzalutamide 处理下的转录组表达谱。源站未提供该数据集的质量评估信息、数据完整性说明、样本量大小、测序深度、批次效应、技术偏差及使用限制等内容。用户在使用时应结合源站记录及关联数据自行判断其适用性。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject,源站为 ncbi.nlm.nih.gov,项目编号为 PRJNA1453527。源站未提供该数据集的具体引用格式、许可协议、使用条款及数据共享政策等信息。用户如需引用或使用该数据,应访问 NCBI BioProject 对应记录页面,查阅源站提供的引用与许可相关说明。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1453527

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症相关成纤维细胞(CAFs)是前列腺肿瘤微环境的关键组成部分,并调节治疗反应。在本研究中,我们旨在探究接受不同抗雄激素治疗的原代人前列腺癌CAFs中的转录组改变。原代CAFs从人前列腺癌组织中分离并在体外培养。细胞被分为三个治疗组:载体对照组(对照)、雄激素剥夺治疗(ADT)以及ADT联合恩杂鲁胺治疗(ADT_Enza)。对9个样本(每组3个生物学重复)进行了高通量RNA测序(RNA-seq),以识别差异表达基因及其潜在的分子机制。该数据集提供了全面的基质转录组图谱,为了解CAFs如何对前列腺癌标准治疗作出反应提供了见解。总体设计:原代人前列腺癌CAFs被培养并分为三组(每组n=3):载体对照组、ADT组和ADT+恩杂鲁胺组。从9个样本中提取总RNA,并进行批量RNA测序,以比较不同治疗条件下的基因表达谱。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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