结直肠癌腹膜转移单细胞转录组EGA数据集
包含结直肠癌腹膜转移患者腹膜转移灶的10x单细胞RNA测序数据。由European Genome-phenome Archive提供,来自European Genome-phenome Archive,数据格式为表格,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的腹膜癌病研究。

基本信息
资源简介
结直肠癌腹膜转移单细胞转录组EGA数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Single-cell transcriptomic analyses of peritoneal metastases from patients with colorectal cancer metastasized to the peritoneum》。
【数据内容】
源站原始描述:The data published here contains single-cell RNA-sequencing (scRNAseq) data as obtained using the 3'' scRNAseq using Chromium Single Cell 3’ Reagent from 10X Genomics on peritoneal metastases (PM) from patients with colorectal cancer (CRC) and PM. Sequencing was performed in a paired-ended fashion on the NovaSeq6000
【主题与分类】
主题标签:None。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000000249
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000000249
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
包含结直肠癌腹膜转移患者腹膜转移灶的10x单细胞RNA测序数据。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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