PTCL浅层全基因组测序数据集

包含PTCL FFPE样本的浅层全基因组测序数据,用于分子标志物和基因组拷贝数相关研究。由European Genome-phenome Archive提供,来自EGA,数据格式为表格,包含147条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的外周T细胞淋巴瘤研究。

European Genome-phenome ArchiveEuropean Genome-phenome Archive
EGA
2025-01-22 更新
浏览 15
表格分类None
EGAD50000001146

基本信息

模态
表格
数据量
147
任务类型
分类
创建/更新时间
2025-01-22

资源简介

PTCL浅层全基因组测序数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Peripheral T cell lymphoma (PTCL) Shallow Whole Genome Sequencing》。

【数据内容】

源站原始描述:Shallow Whole Genome Sequencing (sWGS) of 148 FFPE DNA samples from peripheral T cell lymphoma (PTCL) samples. Assoicated with the "Molecular biomarkers for stratification peripheral T cell lymphoma" study

【主题与分类】

主题标签:None。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000001146

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源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000001146

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含PTCL FFPE样本的浅层全基因组测序数据,用于分子标志物和基因组拷贝数相关研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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