转移性唾液腺癌全基因组测序数据

该数据集来自 ega-archive.org,包含三名转移性唾液腺癌患者的全基因组测序数据。患者接受尸检,从空间上分离的转移部位采集肿瘤活检,并以健康皮肤活检作为对照

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基因组分类None
Whole-genome sequencing data of metastatic salivary gland cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

转移性唾液腺癌全基因组测序数据

该数据集为转移性唾液腺癌的全基因组测序数据,来源于 ega-archive.org,收录于肿瘤/其他分类之下。数据涉及三名转移性唾液腺癌患者,这些患者接受尸检,研究者从空间上相互分离的转移部位采集肿瘤活检样本,同时采集健康皮肤活检作为对照,并对上述样本开展全基因组测序。三名患者中,两名(患者1和患者4)为腺样囊性癌亚型,另一名为肌上皮癌亚型。该数据集的核心价值在于将同一患者不同空间位置的转移灶与健康皮肤对照置于同一测序框架下,为研究转移性唾液腺癌的基因组特征提供了原始数据基础。

【数据集背景】

唾液腺癌是一类相对少见的头颈部肿瘤,其中腺样囊性癌和肌上皮癌是较为典型的亚型。转移性唾液腺癌的基因组研究长期受限于样本获取困难,尤其是来自不同转移部位的配对样本更为稀缺。该数据集通过尸检方式获取多名患者空间分离的转移灶活检,并配以健康皮肤对照,试图在基因组层面刻画转移性病变的分布特征。数据集英文名称为 Whole-genome sequencing data of metastatic salivary gland cancer,来源站为 ega-archive.org,本站分类归入肿瘤/其他。

【数据内容】

数据内容为全基因组测序数据,覆盖三名转移性唾液腺癌患者。样本包括两类:一是从空间上分离的转移部位采集的肿瘤活检,二是作为对照的健康皮肤活检。三名患者中,患者1和患者4为腺样囊性癌,另一名患者为肌上皮癌。源站描述未提供测序平台、测序深度、样本数量、数据文件格式及数据总量等具体技术参数。

【采集与来源】

样本采集依托尸检过程完成,肿瘤活检取自空间上相互分离的转移部位,健康皮肤活检作为对照同步采集。数据来源站为 ega-archive.org。源站未提供采集时间、采集机构、伦理审批信息及样本处理流程等细节。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于转移性唾液腺癌的基因组研究,尤其是比较同一患者不同空间位置转移灶的基因组特征,以及对照健康皮肤组织识别肿瘤相关变异。腺样囊性癌与肌上皮癌两种亚型并存,也为亚型间的对比分析提供了可能。源站未提供具体的适用分析类型或推荐工具。

【使用方法】

源站未提供数据下载方式、访问权限申请流程、文件组织结构和分析流程等使用说明。

【质量与限制】

该数据集样本量较小,仅涉及三名患者,其中腺样囊性癌两例、肌上皮癌一例,结果的统计代表性和泛化能力有限。数据依赖尸检采集,源站未提供样本质量评估、测序质量指标及质控结果。源站未提供其他质量与限制相关信息。

【引用与许可】

源站未提供引用方式、许可协议及数据使用条款等信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000002056

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

(2025). Whole-genome sequencing data of metastatic salivary gland cancer [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD50000002056

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