来自9种不同癌症组织的人源细胞系转录谱分析(NCI-60)

主题标签:肿瘤、转录谱、NCI-60、细胞系、基因表达。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。本数据集为肿瘤领域的基因组公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖肿瘤。

google_dataset
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基因组分类肿瘤转录谱NCI-60细胞系基因表达
Transcription profiling of human cell lines from 9 different cancer tissue (NCI-60)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-14

资源简介

来自9种不同癌症组织的人源细胞系转录谱分析(NCI-60)

该数据集英文名为 Transcription profiling of human cell lines from 9 different cancer tissue (NCI-60),在公开分类中归属于肿瘤 / 其他方向,来源站为 ebi.ac.uk。从主题上看,它围绕肿瘤、转录谱、NCI-60、细胞系与基因表达等关键词展开,属于肿瘤领域的公开数据集。其核心内容是对来自 9 种不同癌症组织来源的人源细胞系进行转录水平检测,形成可用于表达谱分析的数据资源。该数据集由 Uma Shankavaram 于 2008 年发布,并以数据集形式收录于 EBI 相关平台,可通过指定链接访问。整体而言,它为研究不同癌症来源细胞系的基因表达特征提供了公开可用的转录谱资料。

【数据集背景】

该数据集的全称为 Transcription profiling of human cell lines from 9 different cancer tissue (NCI-60),其名称直接点明了研究对象与范围:来自 9 种不同癌症组织的人源细胞系,以及针对这些细胞系开展的转录谱检测。NCI-60 是名称中明确出现的标识,表明该数据集与这一细胞系集合相关。数据集由 Uma Shankavaram 于 2008 年发布,来源站为 ebi.ac.uk,在公开分类中属于肿瘤 / 其他。其主题标签包括肿瘤、转录谱、NCI-60、细胞系、基因表达,说明该资源主要服务于肿瘤转录表达层面的研究需求。源站描述中给出了该数据集的正式引用信息与访问地址,指向 EBI 平台上的相关研究条目。

【数据内容】

依据现有信息,该数据集的内容为来自 9 种不同癌症组织的人源细胞系的转录谱。其主题涵盖肿瘤,并涉及转录谱、细胞系与基因表达等方向。数据集名称中的 NCI-60 表明其细胞系范围与 NCI-60 相关。除上述内容外,关于具体样本数量、检测平台、基因数量、表达值形式、数据文件类型等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中标注了作者 Uma Shankavaram 与发布年份 2008,并给出了访问链接 https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-5949。该链接指向 EBI 平台上的相应研究条目。关于样本采集方式、细胞培养条件、RNA 提取方法、转录谱检测技术、数据处理流程等具体采集与实验信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集属于肿瘤领域的公开数据资源,主题涵盖肿瘤、转录谱、NCI-60、细胞系与基因表达。基于这些主题,它可用于与不同癌症组织来源细胞系的基因表达特征相关的研究场景,也可作为肿瘤转录谱分析、细胞系表达比较等方向的公开数据参考。关于该数据集在特定研究中的具体适用性、可支持的统计分析方法或可验证的生物学结论,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过源站描述中给出的链接访问:https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-5949。关于数据下载格式、文件组织方式、预处理步骤、分析工具或使用协议等具体使用方法,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由 Uma Shankavaram 于 2008 年发布,来源站为 ebi.ac.uk,属于肿瘤领域的公开数据集。关于数据质量评估、样本代表性、批次效应、技术偏差、缺失值情况、数据更新状态或使用限制等具体信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Uma Shankavaram (2008). Transcription profiling of human cell lines from 9 different cancer tissue (NCI-60) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-5949。关于该数据集的许可条款、使用权限或再分发条件,源站未提供。

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-5949

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Uma Shankavaram (2008). Transcription profiling of human cell lines from 9 different cancer tissue (NCI-60) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/arrayexpress/studies/E-GEOD-5949

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